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[交流] 【求助】運行出錯

我在運行PWscf時，出現(xiàn)如下對稱性錯誤，請各位大牛們幫幫忙哈，謝謝各位了！謝謝！

Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue problem:
   a serial algorithm will be used

   Found symmetry operation: I + (  0.0000 -0.5000 -0.5000)
   This is a supercell, fractional translation are disabled
   warning: symmetry operation #  2 not compatible with FFT grid.
0  -1 1
0  -1 0
1  -1 0
   warning: symmetry operation #  3 not compatible with FFT grid.
  -1 0 0
  -1 0 1
  -1 1 0
   warning: symmetry operation #  4 not compatible with FFT grid.
0 1  -1
1 0  -1
0 0  -1
   warning: symmetry operation #  6 not compatible with FFT grid.
0 1  -1
0 1 0
  -1 1 0
   warning: symmetry operation #  7 not compatible with FFT grid.
1 0 0
1 0  -1
1  -1 0
   warning: symmetry operation #  8 not compatible with FFT grid.
0  -1 1
  -1 0 1
0 0 1

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【求助】運行錯誤，大家看看問題在哪？已經(jīng)有7人回復

明察、慎思、篤行

1樓 2010-09-17 10:55:03

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163.com(金幣+1):謝謝參與 2010-09-17 23:02:10
gleerat(金幣+1): 2010-10-07 11:09:10

貼出你的輸入文件吧，否則不知道你的問題在哪里。

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2樓2010-09-17 21:25:31

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Originally posted by goldenfisher at 2010-09-17 21:25:31:
貼出你的輸入文件吧，否則不知道你的問題在哪里。

&CONTROL

               calculation = 'scf' ,

            restart_mode = 'from_scratch' ,

                  outdir = './' ,

               pseudo_dir = './' ,

                  prefix = 'CaFe2As2' ,

                  disk_io = 'default' ,

               verbosity = 'default' ,

                  tprnfor = .true. ,

/

&SYSTEM

                     ibrav = 10,

               celldm(1) = 5.5062,

               celldm(2) = 5.4502

               celldm(3) = 11.664,

                     nat = 5,

                     ntyp = 3,

                  ecutwfc = 30.0 ,

                  ecutrho = 320.0 ,

                     nosym = .false. ,

                     nbnd = 80,

               occupations = 'smearing' ,

                  degauss = 0.05 ,

                  smearing = 'marzari-vanderbilt' ,

                     nspin = 1 ,

/

&ELECTRONS

               mixing_beta = 0.3 ,

               mixing_ndim = 10,

         diagonalization = 'david' ,

/

ATOMIC_SPECIES

Ca 40.078    Ca.pbe-nsp-van.UPF

Fe 55.845    Fe.pbe-nd-rrkjus.UPF

As 74.92159 As.pbe-n-van.UPF

ATOMIC_POSITIONS crystal

  Ca 0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000 1 1 1

  Fe 0.2500000000000000  0.2500000000000001  0.2500000000000001 1 1 1

  Fe 0.2500000000000000 -0.2500000000000001  0.2500000000000001 1 1 1

  As 0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.3546994010087879 1 1 1

  As 0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.1453005989912119 1 1 1

K_POINTS automatic

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3樓2010-10-07 11:12:58

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Originally posted by goldenfisher at 2010-09-17 21:25:31:
貼出你的輸入文件吧，否則不知道你的問題在哪里。

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4樓2010-10-07 11:21:22

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Originally posted by goldenfisher at 2010-09-17 21:25:31:
貼出你的輸入文件吧，否則不知道你的問題在哪里。

這是我算的體系的晶格結構，輸入文件跟出錯都在上面了，麻煩各位高手指點一下，不勝感激。
PW好像是以指定格子類型后找基元的方式建模的，可能這方面做錯了，請各位指點。謝謝。。。

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5樓2010-10-07 11:24:22

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★
zxzj05(金幣+1):謝謝回帖交流 2010-10-07 22:44:36
gleerat(金幣+1): 2010-10-08 10:53:59

用xcrysden看一下你的結構吧,
你的celldm(1)(2)(3)是原子單位嗎?
建議
ibrav=14
a=
b=
c=
cosbc=
cosac=
cosab=
這樣輸入結構不易出錯.
上面單位埃

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由天命,成人事！

6樓2010-10-07 19:03:22

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★ ★
zxzj05(金幣+2):謝謝回帖交流 2010-10-07 22:44:46
gleerat(金幣+1): 2010-10-08 10:54:06

ibrav=10是Orthorhombic face-centered晶體構型。你要確認你的晶體確實是這種構型。我認為你寫出來的晶體原子坐標和你畫出來的圖不一致。你的是正交系，我想用ibrav=8,然后把每個不等價的原子坐標都寫出來就可以了。
另外，樓上的同仁，我想pwscf中的單位都是原子單位，celldm(1)=a的單位應該是bohr，celld(2)(3)則是相對celldm(1)的值，也就是celldm(2)=b/a，celldm(3)=c/a。

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7樓2010-10-07 22:04:07

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引用回帖:

Originally posted by goldenfisher at 2010-10-07 22:04:07:
ibrav=10是Orthorhombic face-centered晶體構型。你要確認你的晶體確實是這種構型。我認為你寫出來的晶體原子坐標和你畫出來的圖不一致。你的是正交系，我想用ibrav=8,然后把每個不等價的原子坐標都寫出來就可以了 ...

您好，我想問一下，按你說的用ibrav=8，那么請問，您覺得不等價原子應該是哪幾個呢？我先前也用過ibrav＝8，但是感覺不等價原子是不是太多了，PW好像不會自動去找更小的原胞的吧？在算聲子的時候原子太多是不是不好呢？謝謝！

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8樓2010-10-08 11:10:33

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引用回帖:

warning: symmetry operation #  3 not allowed. fractional translation:
   0.5000000  0.0000000  0.5000000  in crystal coordinates
   warning: symmetry operation #  4 not allowed. fractional translation:
   0.0000000  0.5000000  0.5000000  in crystal coordinates
   warning: symmetry operation #  7 not allowed. fractional translation:
   0.0000000  0.5000000 -0.5000000  in crystal coordinates
   warning: symmetry operation #  8 not allowed. fractional translation:
   0.5000000  0.0000000 -0.5000000  in crystal coordinates
我改了一下輸入文件，出現(xiàn)以上的錯誤，一下是輸入文件，請指教，謝謝你。

&CONTROL

               calculation = 'scf' ,

            restart_mode = 'from_scratch' ,

                  outdir = './' ,

               pseudo_dir = './' ,

                  prefix = 'CaFe2As2' ,

                  disk_io = 'default' ,

               verbosity = 'default' ,

                  tprnfor = .true. ,

/

&SYSTEM

                     ibrav = 8,

               celldm(1) = 5.5062,

               celldm(2) = 5.4502

               celldm(3) = 11.664,

                     nat = 14,

                     ntyp = 3,

                  ecutwfc = 30.0 ,

                  ecutrho = 320.0 ,

                     nosym = .false. ,

                     nbnd = 80,

               occupations = 'smearing' ,

                  degauss = 0.05 ,

                  smearing = 'marzari-vanderbilt' ,

                     nspin = 1 ,

/

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               mixing_ndim = 10,

         diagonalization = 'david' ,

/

ATOMIC_SPECIES

Ca 40.078    Ca.pbe-nsp-van.UPF

Fe 55.845    Fe.pbe-nd-rrkjus.UPF

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ATOMIC_POSITIONS crystal

  Ca 0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000 1 1 1

  Ca 0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000 1 1 1

  Ca 0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.5000000000000000 1 1 1

  Ca 0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.5000000000000000 1 1 1

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  Fe 0.2500000000000000  0.2500000000000001  0.7500000000000001 1 1 1

  As 0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.3546994010087879 1 1 1

  As 0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.3546994010087879 1 1 1

  As 0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.1453005989912119 1 1 1

  As 0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.1453005989912119 1 1 1

  As 0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.6453005990000000 1 1 1

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  As 0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.8546994010000000 1 1 1

  As 0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.8546994010000000 1 1 1



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9樓2010-10-08 11:56:25

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★
cenwanglai(金幣+1):謝謝回復！ 2010-10-10 09:11:48

你的第二個輸入文件和第一個得到的晶體不一樣
其次，這個問題貌似在于你的晶體構型有點奇怪，你確定a只有3埃不到？你可以修改看看。我沒有遇到過這個問題，可以上mailist看看

[ Last edited by goldenfisher on 2010-10-9 at 11:46 ]

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10樓2010-10-09 11:44:12

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