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hnuzhoulin金蟲 (小有名氣)
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[求助]
原來編譯的siesta突然不能用，重新編譯沒錯，運行出錯
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前幾天才嘗試用gfortran和mpich2編譯siesta，通過了，并且在test目錄和example、目錄下都能夠計算得到差不多的結果。由于當時安裝的mpich2用的是mpd，后來改用新版的mpich2換hydra作為進程調(diào)度的系統(tǒng)，于是重新編譯了一下：這次嘗試用ifort10+mpich2，編譯過程沒什么錯誤，但是在test目錄下make，得到的錯誤如下： 于是我將可執(zhí)行文件拷貝到第一次正確運行（gfortran編譯成功那次）的目錄，再次 ./siesta initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ---------- Species number: 1 Label: O Atomic number: 8 Species number: 2 Label: H Atomic number: 1 Ground state valence configuration: 2s02 2p04 Reading pseudopotential information in formatted form from O.psf Semicore shell(s) with -5 electrons included in the valence for O Ground state valence configuration: 1s01 Reading pseudopotential information in formatted form from H.psf O must be in PAO.Basis (it has semicore states) Stopping Program from Node: 0 application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 [unset]: aborting job: application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 不明白啊，為啥編譯沒問題，運行卻出錯？？ 還有曾經(jīng)還編譯出一個版本，在前臺可以算，rocks集群系統(tǒng)交到后臺有進程，但是不計算，郁悶啊。 求教。 [ Last edited by hnuzhoulin on 2011-7-19 at 16:02 ] |
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