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[交流]
[軟件編譯交流]如下的編譯問題你了解多少？
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在linux下的計算，第一步就是需要編譯相應(yīng)的計算軟件（或許師兄師姐已經(jīng)幫助編譯好了），然后才是用來做具體的計算。關(guān)于軟件編譯，大家了解到什么程度？對于下面這幾個問題，大家來測試一下吧�；卮饐栴}有金幣獎勵哦~歡迎補充相關(guān)問題，歡迎補充相應(yīng)的答案~ 推薦一本關(guān)于makefile的文檔《跟我一起寫 Makefile》，大家有空看以看看，鏈接如下：http://www.chinaunix.net/jh/23/408225.html 一、關(guān)于ifort 1. FFLAGS = -FR -lowercase -assume byterecl -heap-arrays 上述編譯選項分別代表什么意義？有什么用途？（每個選項10個金幣） 2. OFLAG的選項O1, O2, O3等三個優(yōu)化選項分別有什么優(yōu)勢和劣勢？怎樣針對自己的體系進行選擇？（每個選項10個金幣） 二、關(guān)于mkl 1.對于intel64而言，下列這幾個選項分別代表什么意義？起什么作用？ -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64 -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_core -lrt -lsvml -limf -lm（每個選項10個金幣） 2.對于em64t而言 ， 下列這幾個選項分別代表什么意義？起什么作用？（每個選項10個金幣） -lmkl_em64t -lguide -lpthread -limp -lm 三、關(guān)于mpif90 下列這幾個選項分別代表什么意義？起什么作用？需要賦值的選項分別賦多大值合適？（每個選項10個金幣） -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc -DMPI_BLOCK=8000 [ Last edited by uuv2010 on 2012-2-11 at 15:16 ] |
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2樓2012-02-11 15:11:37
souledge
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怎么都是ifort的啊，并且這些都是編譯VASP時重要的編譯參數(shù)～
3樓2012-02-11 15:34:05
uuv2010
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俺是說讓版主補充問題，最好還能順便提供答案……5樓2012-02-11 15:37:45
uuv2010
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11樓2012-02-13 09:07:15
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zzy870720z(金幣+2): 鼓勵交流，不錯哦 2012-03-03 08:31:52
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關(guān)于O1、O2、O3等參數(shù)，ifort的help文檔是如下說明的： -O1 optimize for maximum speed, but disable some optimizations which increase code size for a small speed benefit. （最大速度的優(yōu)化） -O2 enable optimizations (DEFAULT) （增強優(yōu)化，這個是默認選項） -O3 enable -O2 plus more aggressive optimizations that may not improve performance for all programs -O0 disable optimizations （不優(yōu)化） -O same as -O2 （默認選項，同O2） [ Last edited by uuv2010 on 2012-2-13 at 09:30 ] |
12樓2012-02-13 09:27:24
13樓2012-02-13 20:40:38
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
uuv2010(金幣+10): 贊！ 2012-02-13 21:30:51
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| Intel的EM64T技術(shù)，EM64T技術(shù)官方全名是Extended Memory 64 Tenchnology 中文解釋就是擴展64bit內(nèi)存技術(shù)�，F(xiàn)在的32位奔騰 4 CPU都是采用IA-32指令集，EM64T其實就是在這個指令集的基礎(chǔ)上進行擴展，我們將它命名為IA32e。Intel這種實現(xiàn)64位的方法其實和AMD的x86-64技術(shù)有異曲同工之妙，都是通過64位擴展指令來實現(xiàn)兼容32位和64位的運算。另外不同的是Intel的EM64T技術(shù)設(shè)定了IA-32和IA-32e兩種模式的激活程序，就是說EM64T需要滿足特定條件才會激活。 |
14樓2012-02-13 20:52:04
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zzy870720z(金幣+2): 鼓勵交流，但好像有點文不對題吧，呵呵 2012-03-03 08:33:12
zzy870720z(金幣+2): 鼓勵交流，但好像有點文不對題吧，呵呵 2012-03-03 08:33:12
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下面是一個使用Intel MKL 進行矩陣計算的例子。 通過的這個例子，我們可以了解如何使用Intel MKL 的函數(shù)庫： 1>程序說明：下面的matrix.c 文件分別調(diào)用 C 代碼，Intel MKL BLAS Level 1 函數(shù) (ddot), BLAS Level 2 函數(shù)(dgemv) 與 BLAS Level 3的函數(shù)(DGEMM)完成矩陣計算： roll_your_own_multiply 是 C 源代碼，它直接依賴編譯器生成優(yōu)化代碼。Ddot_Multiply，Dgemv_multiply使用Intel MKL 函數(shù)實現(xiàn)部分矩陣運算。Dgemm_multiply 直接調(diào)用MKL 的矩陣計算函數(shù)。 2>程序編譯與鏈接： 下面是在Linux 32 的系統(tǒng)上，使用Intel Compiler編譯該程序并鏈接Intel MKL 10.0的例子： > source /opt/intel/cc/10.x.xxx/bin/iccvars.sh #設(shè)置Intel Compiler 環(huán)境變量 > icl –o matrix –I/opt/intel/mkl/10.0.xxxxx/include/ matrix.c-L/opt/intel/mkl/10.0.xxxx/lib/32/ -lmkl_intel_c -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide40.lib –lpthread 其他的鏈接的方式，大家可以查看下面的帖子：http://support.intel.com/support ... ls/sb/CS-028699.htm 3> 程序執(zhí)行： > source /opt/intel/mkl/10.0.xxxxx/tools/environment/mklvars32.sh #程序使用動態(tài)方式鏈接MKL函數(shù)時，設(shè)置MKL的環(huán)境變量。 >./matrix 4> 設(shè)置多線程運行：在Intel MKL 10.0 使用OpenMP* 實現(xiàn)多線程。 OpenMP*程序可以通過環(huán)境變量 OMP_NUM_THREADS 去控制線程的數(shù)目。 > export OMP_NUM_THRADS=4 #設(shè)置程序的線程為 4 > ./matrix #DGEMM在執(zhí)行的時候使用4個線程。 注意：在MKL 10.0 中， 如果OMP_NUM_THREADS沒有定義，MKL函數(shù)可能會根據(jù)數(shù)據(jù)的大小，以及其他的變量來設(shè)置線程數(shù)目， 缺省時，可能運行多個線程運行。 源程序下載的URL: http://download355.mediafire.com ... hflsx1md/testcode.c |
15樓2012-02-13 20:53:56
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
zzy870720z(金幣+2): 謝謝分享，呵呵 2012-03-03 08:33:26
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
zzy870720z(金幣+2): 謝謝分享，呵呵 2012-03-03 08:33:26
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安裝icc和ifort： 在Intel網(wǎng)站下載9.1.047版icc（我是沒安裝，可以不裝）和9.1.043版ifort，然后按網(wǎng)站要求申請許可證，并按提示進行安裝即可，我都是全部安裝的。基本上10版本的ifort安裝很方便就完成的。重 要一點就是必須先建立ifort的安裝目錄，并且把lincese文件復(fù)制進入對應(yīng)目錄里。 1、 把icc和ifort的路徑加入到環(huán)境變量中： 把安裝目錄下bin文 件夾中的iccvars.sh和ifortvars.sh拷貝到/etc/profile.d中。 這個很重要，作了就可以進行下面的MPI的配置和MAKE了，否則死都過不去！ 2、 卸載 按照說明說的介紹，PDF里有介紹如何卸載的 第四 品 配置ssh: 1、 安裝ssh 本來是可以不要的， 不過操作起來很簡單，就順手都給安裝上了 yum install openssh openssh-server openssh-clients openssh-askpass 2、 編輯/etc/hosts， 這一步我覺得單機并行似乎可以不要，不過以前這么做的，沒有問題，所以 現(xiàn)在還這么做 加入一行：127.0.0.1 node01 c.啟動sshd并自動生成密鑰： /etc/rc.d/init.d/sshd start 加入啟動服務(wù)： chkconfig --level 5 sshd on d.限制其它人連接：兩種做法：a.設(shè)置iptables，b.編輯/etc/hosts.deny和/etc/hosts.allow， 這兩個文件的格式忘掉了，有需要的同學(xué)可以查一下。 |
16樓2012-02-13 20:54:48
17樓2012-03-02 14:43:54
18樓2012-03-02 14:52:00
19樓2012-08-23 10:34:04
20樓2014-12-08 10:49:33
簡單回復(fù)
2012-02-11 15:55
回復(fù)
2012-02-11 17:29
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uuv201010樓
2012-02-11 18:49
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