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[交流]
【求助/交流】如何通過序列對(duì)比分析預(yù)測(cè)一個(gè)基因的功能 已有4人參與
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| 請(qǐng)精通生物信息學(xué)的大俠指教，如何系統(tǒng)的通過生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)和注解基因功能。我只是知道BLAST（BLASTP和BLASTN哪個(gè)準(zhǔn)確？），對(duì)于clustal也不太會(huì)用，系統(tǒng)進(jìn)化樹對(duì)基因的注解很重要嗎？ |
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三磷酸腺苷
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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3樓2010-09-24 14:30:04
★ ★ ★
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lstt09nk(金幣+2):感謝交流，歡迎常來~ 2010-09-24 14:19:57
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
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| BLASTN是指用核苷酸序列搜索相似的核苷酸序列。BLASTP是指用蛋白序列搜索相似的蛋白序列。我們一般都用BLASTN，當(dāng)BLASTN找不到滿意的結(jié)果是，可以試試BLASTP。系統(tǒng)進(jìn)化樹只是說明該基因在進(jìn)化過程中的位置，只能說明其序列的相似性位于什么位置，對(duì)于其功能的進(jìn)化位置不怎么靠譜。因?yàn)樵诓煌锓N中，相似的序列可能發(fā)揮不一樣的功能。以上只是個(gè)人意見，僅供參考�？梢远嗫纯聪嚓P(guān)文章是怎樣定義一個(gè)基因的。 |
2樓2010-09-24 13:06:51
yuanbo934
至尊木蟲 (著名寫手)
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4樓2010-09-25 10:33:26
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