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[交流]
【求助/交流】如何通過序列對比分析預(yù)測一個(gè)基因的功能 已有4人參與
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| 請精通生物信息學(xué)的大俠指教,如何系統(tǒng)的通過生物信息學(xué)分析預(yù)測和注解基因功能。我只是知道BLAST(BLASTP和BLASTN哪個(gè)準(zhǔn)確?),對于clustal也不太會用,系統(tǒng)進(jìn)化樹對基因的注解很重要嗎? |

至尊木蟲 (著名寫手)
| BLASTN是指用核苷酸序列搜索相似的核苷酸序列。BLASTP是指用蛋白序列搜索相似的蛋白序列。我們一般都用BLASTN,當(dāng)BLASTN找不到滿意的結(jié)果是,可以試試BLASTP。系統(tǒng)進(jìn)化樹只是說明該基因在進(jìn)化過程中的位置,只能說明其序列的相似性位于什么位置,對于其功能的進(jìn)化位置不怎么靠譜。因?yàn)樵诓煌锓N中,相似的序列可能發(fā)揮不一樣的功能。以上只是個(gè)人意見,僅供參考?梢远嗫纯聪嚓P(guān)文章是怎樣定義一個(gè)基因的。 |

鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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