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bs340248銅蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】請教temp/berendsen命令中弛豫時間的問題
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fix temp/berendsen command 1, Reset the temperature of a group of atoms by using a Berendsen thermostat (Berendsen), which rescales their velocities every timestep. 2, The Tdamp parameter is specified in time units and determines how rapidly the temperature is relaxed. 這個命令的解釋里面,控制溫度是通過每步改變速度來實現(xiàn)的對吧,但是這個Tdamp所說的弛豫時間到底指的是什么。恳郧拔乙恢币詾槭沁^一段弛豫時間后調(diào)整溫度,現(xiàn)在想想弛豫時間好像不是指這個。 |
木蟲 (著名寫手)
金蟲 (正式寫手)
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嗯, 這個解釋很清楚. 注意的是, 這個Tdamp的單位也是時間, 但是, 不要將它的數(shù)值以及單位和run的步數(shù)已經(jīng)timestep混淆起來, 兩者沒啥關(guān)系. 如果Tdamp太小, 會導致這個錯誤: Dump dcd of non-matching # of atoms 太大的話, 溫度的控制效果不好, 會有比較大的波動. 總之, 這個參數(shù)要自己找一下最優(yōu)值. |

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