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【求助/交流】實驗啊,老做不出來(HEV(正鏈RNA病毒)的全基因組克隆) 已有2人參與
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小弟一直在做HEV(正鏈RNA病毒,糞口傳播)的全基因組克隆?墒且恢睕]結果。現(xiàn)在把我的條件拿出來,請各位高手幫我分析一下原因吧,郁悶死了! 一:RNA的提取 用OMEGA試劑盒提取豬糞中的RNA。(豬糞用PBS溶解)。 二:RT 反轉錄用的是MBI試劑盒。RNA定量為1ug。反轉錄引物用過特異性引物和oligo(dT);蛘邇烧呋旌稀 三:PCR PCR所用引物特異性很好(軟件比對結果顯示),cDNA加2ul。 四:目的片段 一個長1.2k。一個約6.35k。1.2k的用的是TAKARA的普通Taq酶。6.35k的用的是TAKARA的LA Taq酶。 結果: 可以說一直沒有結果。1.2kP出的條帶都小于500bp,要不就什么都沒有。6.35k的結果也一樣,要不什么都沒有,要不在9.6k處有一條不清晰的帶(不可能,因為HEV基因組全長才7.2k)。 說明:RNA肯定是提出來了,因為做陽性篩選的時候擴增的436bp的條帶每次重復都會出現(xiàn),即陽性對照沒問題(擴增片段靠近基因組3’端);RT應該沒問題,因為試劑盒中的陽性對照擴增也沒問題。 小弟真的很郁悶,一個簡單的RT-PCR都做不好,也難怪2個老板都十分惱怒。請各位高手幫我分析分析原因吧,謝謝了! |

銀蟲 (小有名氣)
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