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zhilv金蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】求助哪位大俠幫我分析下電子密度差分圖 已有9人參與
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Dmol3 calculation |
金蟲 (初入文壇)
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說實(shí)在話,我對分析電子密度差所知甚少,也就是這幾天才開始搞的. 審稿人要我搞個電子密度圖,但我個人感覺電子密度圖其實(shí)也得不到什么好的信息,看了下您的帖子,我就嘗試得做了下“全分子與其中每個原子”的電子密度差分圖。 對于你的第二點(diǎn):我的分子式是X-BF2(+) 對于你的第二點(diǎn):我做的是全分子的密度差分圖。 對于你的第三點(diǎn):我作的是“全分子與其中每個原子”的電子密度差分圖。 從這圖看出A-B是共價鍵的特征,但審稿人說X...BF2(+)之間是“ion-induced dipole interaction”,那A-B是共價鍵的特征就不成立了啊。 本來BF2(+)分子是直線型的。但形成X...BF2(+)化合物后,單個的BF2(+)部分是c2v型的,如果是離子誘導(dǎo)偶極作用的話,BF2(+)部分的構(gòu)型應(yīng)該差不多還是直線型的阿。 |
版主 (著名寫手)
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這張圖作得不錯。但對圖的分析你提供的信息還不夠: 首先,你出示的分子要標(biāo)注各是什么原子,以便在不知道MO數(shù)據(jù)的情形下,猜測是怎樣成鍵的,估計各自的共價半徑,這有利于分析你提出的問題; 其次,要告訴是全分子的還是某個MO的密度差分圖,因?yàn)榭赡苡形磪⑴c成鍵的MO也會有一定的密度差疊加在成鍵的MO的密度差之中,加大分析的難度; 第三,密度差是全分子與其中每個原子的還是全分子與A和BC2作為一個整體分子片的?。 僅從圖形看,A的體積大,電負(fù)性小(相對于基團(tuán)BC2),與B成共價鍵,A的電荷轉(zhuǎn)移到BC2上。 A轉(zhuǎn)移走了大量電荷,A上剩余電荷向內(nèi)收縮,你的基組較高,這點(diǎn)也反映出來了。 AB之間的鍵中間也有電荷密度增加,這是共價鍵的特征。 BC2自然有相應(yīng)的電荷密度增加。 [ Last edited by zhou2009 on 2010-10-9 at 20:59 ] |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
金蟲 (著名寫手)

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