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[交流]
【求助/交流】蛋白質(zhì)大小 已有7人參與
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| 對(duì)蛋白質(zhì)不了解，弱弱的問一下，一般蛋白質(zhì)的大小有多大，因?yàn)槲蚁胗玫鞍踪|(zhì)吸附包被納米材料，材料有2-5納米大，不知道蛋白質(zhì)的大小是否夠，也就是蛋白質(zhì)是不是可以比2-5納米大，問題比較弱智，不好意思。 |
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首先去pdb數(shù)據(jù)庫(kù)下載bsa的蛋白結(jié)構(gòu)（download files——pdf file （text），現(xiàn)以4F5S為例），安裝pymol軟件，使用pymol打開下載的bsa文件。左上角 all-A-preset-pretty，你能獲得一個(gè)飄帶圖（圖1）�；氐絧ymol的控制界面，wizard-measurement 你會(huì)在右下角獲得一個(gè)對(duì)話框。點(diǎn)擊distance，而后點(diǎn)擊你想測(cè)量的兩個(gè)氨基酸中的原子，就會(huì)給出你距離，如圖2. BAS.png BSA2.png |
13樓2015-05-28 23:27:43
月月大可
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那得看蛋白質(zhì)的形狀啊。就算是同一個(gè)蛋白，球狀的和變性以后棒狀的還不一樣大呢。 研究的比較透的蛋白，結(jié)構(gòu)解析過的話，都會(huì)有相應(yīng)的空間結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的，pdb數(shù)據(jù)庫(kù)里找找看。要是只有序列的話，找?guī)讉�(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)模擬一下結(jié)構(gòu)，也能給出個(gè)大概的大小 |
4樓2010-10-11 16:20:58
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10樓2015-05-25 23:16:09
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