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[交流]
【求助】高分子模擬中鏈上小珠的距離問題 已有2人參與
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各位大俠好，我是一名fortran編程的新手，我要做一個高分子在通道中運動的一個MD的模擬，但是相鄰小珠之間的距離我要不要考慮進(jìn)去呢？在運行的時候總是有相鄰的珠子之間的距離很遠(yuǎn)，以至于我覺得它已經(jīng)不是一條鏈了，小珠會到處亂飛，請問這是正常的么？如果不正常我該如何實現(xiàn)這一部分的編程呢？請高手指教！ 謝謝！ |
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yahoohoo
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-10-23 08:49:16
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-10-23 08:49:16
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相鄰 BEADS之間的距離由相互作用所控制。比如你采用Harmonic Potential $U_b = 1/2 k_b (r - r_0)^2$，那么相鄰 BEADS 之間的距離平均值應(yīng)該在$r_0$。 “亂飛”是什么概念，：）。請用專業(yè)化的語言來描述。你在模擬中是否采用了周期性邊界條件以及最小鏡像法則( Minimum Image Convention)？ 可能的話，建議你使用c++。fortran的語法太死板，編寫好的程序管理以及修改不如c++方便。 |
2樓2010-10-22 22:23:02
3樓2010-10-22 23:53:45
yahoohoo
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4樓2010-10-23 03:31:14
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