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駱寒銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】幾個(gè)序列的拼接 已有9人參與
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請問有人知道用什么軟件可以實(shí)現(xiàn)不同序列的拼接嗎?有人告訴我說bioedit可以,但我不會用,求教。 我的是rbcl片段和trnL-F片段,還有psbA片段,每個(gè)測了40個(gè)樣品,現(xiàn)在希望把個(gè)樣品的三個(gè)片段拼接起來一起分析,求教具體操作。 |

鐵桿木蟲 (著名寫手)
銀蟲 (小有名氣)


榮譽(yù)版主 (知名作家)
海納百川

木蟲 (正式寫手)
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樓主的意思是將三個(gè)基因按順序一個(gè)個(gè)前后連接起來,不是將一個(gè)基因兩端測序后,拼接起來。 在BioEdit中打開一個(gè)序列,然后將序列上方的一個(gè)菜單:Mode下拉式菜單改為Edit,將光標(biāo)移動到序列的最末端,從粘貼板上粘貼你要增加的第二個(gè)序列即可。這樣三個(gè)序列都前后連接到一起了。 這需要一個(gè)一個(gè)來,十分麻煩。Mega5軟件支持將比對后的序列一下子全部放到另外一個(gè)比對后的序列后面。因此在序列連接(或拼接)中,用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做連接時(shí),要選擇Edit/Build alignment,不能是Edit/view選項(xiàng),否則不能編輯。 [ Last edited by 51chuguo on 2012-11-25 at 10:38 ] |
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