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Ran2010新蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助/交流】關(guān)于酵母蛋白激酶網(wǎng)絡(luò)測(cè)繪的一些問題
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看了今年science上的酵母中蛋白激酶和磷酸化酶網(wǎng)絡(luò)測(cè)繪的文章 剛剛接觸這方面的東西，有很多不明白的，希望大家?guī)蛶兔 1.首先他用這樣一個(gè)流程來(lái)測(cè)繪： 抗原決定表位標(biāo)記，磁子捕獲，胰蛋白酶分解，質(zhì)譜測(cè)定，hit scoring matrix，顯著性分析，網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 兩個(gè)蛋白之間的反應(yīng)是怎么被確定的？hit scoring matrix是什么，其橫坐標(biāo)為baits，縱坐標(biāo)為hits，分別代表什么含義？ 2.TOR（target of rapamycin）含量的上升會(huì)導(dǎo)致更高的rapamycin抵抗力么？如果TOR complex的某些成分和其他激酶或磷酸化酶反應(yīng)，會(huì)導(dǎo)致抵抗力變化么？ 3.NNK1（N網(wǎng)絡(luò)激酶）與TOR complex1的成分蛋白和Gdh2（glu 分解酶，分解產(chǎn)物是氨和酮戊二酸）相互作用。NNK1的過量表達(dá)會(huì)導(dǎo)致對(duì)rapamycin敏感。 現(xiàn)象是在glu作為唯一氮源的培養(yǎng)基上，gdh缺陷型會(huì)表現(xiàn)出rapamycin抵抗力 能幫解釋一下原因么？是因?yàn)間lu作為氮源時(shí)，Gdh2的表達(dá)量會(huì)升高，從而誘導(dǎo)NNK1的表達(dá)升高么？ 4.最后一個(gè)問題，TOR complex1 effector Ure2 通過在細(xì)胞質(zhì)內(nèi) sequestering 轉(zhuǎn)錄因子Gln3 來(lái)調(diào)節(jié)nitrogen catabolite response， 這句話的英文部分我不太明白，麻煩幫解釋下（不是翻譯哈）~ 問題很多，麻煩大家了，謝謝先~ |
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林祎
木蟲 (正式寫手)
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2樓2010-11-07 21:51:52
Ran2010
新蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 生物信息學(xué)
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a globla protein kinase and phosphatase interaction network in yeast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20489023 |
3樓2010-11-08 07:15:59
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