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[交流]
【求助/交流】關于酵母蛋白激酶網(wǎng)絡測繪的一些問題
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看了今年science上的酵母中蛋白激酶和磷酸化酶網(wǎng)絡測繪的文章 剛剛接觸這方面的東西，有很多不明白的，希望大家?guī)蛶兔 1.首先他用這樣一個流程來測繪： 抗原決定表位標記，磁子捕獲，胰蛋白酶分解，質譜測定，hit scoring matrix，顯著性分析，網(wǎng)絡構建 兩個蛋白之間的反應是怎么被確定的？hit scoring matrix是什么，其橫坐標為baits，縱坐標為hits，分別代表什么含義？ 2.TOR（target of rapamycin）含量的上升會導致更高的rapamycin抵抗力么？如果TOR complex的某些成分和其他激酶或磷酸化酶反應，會導致抵抗力變化么？ 3.NNK1（N網(wǎng)絡激酶）與TOR complex1的成分蛋白和Gdh2（glu 分解酶，分解產(chǎn)物是氨和酮戊二酸）相互作用。NNK1的過量表達會導致對rapamycin敏感。 現(xiàn)象是在glu作為唯一氮源的培養(yǎng)基上，gdh缺陷型會表現(xiàn)出rapamycin抵抗力 能幫解釋一下原因么？是因為glu作為氮源時，Gdh2的表達量會升高，從而誘導NNK1的表達升高么？ 4.最后一個問題，TOR complex1 effector Ure2 通過在細胞質內 sequestering 轉錄因子Gln3 來調節(jié)nitrogen catabolite response， 這句話的英文部分我不太明白，麻煩幫解釋下（不是翻譯哈）~ 問題很多，麻煩大家了，謝謝先~ |
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林祎
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2樓2010-11-07 21:51:52
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a globla protein kinase and phosphatase interaction network in yeast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20489023 |
3樓2010-11-08 07:15:59
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