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1樓 2010-10-20 01:55:48

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taigongzaici

新蟲 (小有名氣)

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生物信息學(xué)可是大牛啊。好好學(xué)吧，

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2樓2010-10-20 08:28:13

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reasonspare

木蟲 (著名寫手)

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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lstt09nk(金幣+5):很好，很詳細 2010-10-20 09:19:46

引用回帖:

Originally posted by cheilove at 2010-10-20 01:55:48:
老師是做馬鈴薯生物技術(shù)的。說既然我計算機比較好，就建議我做馬鈴薯（主要材料）的生物信息學(xué)，可以不做實驗，我了個暈，編程，測序？我問那這方向以后干嘛啊。他說可以轉(zhuǎn)向計算機軟件，可以搞藥物開發(fā)啊。我…。 ...

建議摟主，回頭好好的補一補生物信息學(xué)，不管你作為不作為你的主打方向，都是有好處的：

生物信息學(xué)，是一個很系統(tǒng)的東西，也是一個很有用的東西。除了每天去genbank，意外你還要多事情要做：
我只給你舉些常見的例子：
模型分析型：好多國內(nèi)外優(yōu)秀生物學(xué)服務(wù)器，都是基于自己的一個模型（可能是一個很小的SCI paper）發(fā)展成為學(xué)界大牛（PFAM: http://pfam.sanger.ac.uk/search. 模型：hidden Markov models （HMMs））通過對部分一致基因的分析，就能拿到保守位點，從而對未知基因進行功能預(yù)測: 尤其是基因家族。其他的保守位點分析如：MEME,

大小通吃型：就如Genbank,Uniprot 就屬于這種性質(zhì)，想象一下全世界所有人的測序結(jié)果都要提交那里。如果你想知道你的基因是否有人研究過，也要到那里進行比較。其意義我就不說。

專業(yè)性：就如MASCOT, KEGG.我就業(yè)不多說了

揀便宜型：現(xiàn)在如果建立一個genbank第二，已經(jīng)是沒有意義的事情了，所以許多人開始撿便宜，我就給你舉個例子（實際情況可能有誤差） :韓國有一家網(wǎng)站，整理了Genbank里所有的16S rDNA,然后進行系統(tǒng)命名，我們都知道如果想知道一個細菌是那個種，必須要知道16S.換句話說你拿到你的菌株16S 就可以去他的網(wǎng)站比對了。哈哈，很簡單不是嗎。

編程摟住看了不要暈：你不要想想象windows的那種大程序，動不動上萬頁紙。
比如從Genbank拿ABC transporter或任何逆向分析的基因家族來說吧：一小段代碼：絕對不超過一頁紙，就能讓你拿到所有生物的基因。如果稍微補充一下代碼（幾句話），就能讓你的代碼每天/月去掃描一遍Genbank，如果有人提交到了genbank，你這里也能得到更新。這就是生物學(xué)。

當(dāng)然我之舉了一個例子，而且相當(dāng)狹義，
生物學(xué)信息學(xué)的東西很多那。

就拿到你提到的藥物卡發(fā)來說：
說神秘一點也不神秘：
比如你想開發(fā)一個針對馬鈴薯的除草劑。你手頭上有個除草劑挺好，就是把馬鈴薯也搞死了。你要研究一個新藥物，能除草但是不能殺馬鈴薯。
于是你了解這個除草劑的成分，功能，靶蛋白（大多數(shù)除草劑都有靶蛋白如GABA）,當(dāng)然你就能找到馬鈴薯的這個蛋白的序列。通過蛋白質(zhì)建模工具，你就知道藥物和蛋白的結(jié)合位點。通過調(diào)節(jié)藥物的空間結(jié)構(gòu)，比如添加一個羥基，增加一個苯環(huán)，使得該藥物對馬鈴薯不是很敏感，這樣你就目的就達到了，找個人合成這個化學(xué)物質(zhì)，拿馬鈴薯試一試，效果不錯，申請專利，效果不好，發(fā)表文章，效果很差，重新再來。

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大慈大悲觀世音救苦救難觀世音有求必應(yīng)觀世音普渡眾生觀世音千手千眼觀世音官大敢管觀世音無處不在觀世音普觀普長觀世音南無觀世音菩薩

3樓2010-10-20 09:02:21

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cheilove

禁蟲 (正式寫手)

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4樓2010-10-20 11:30:24

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silicare

榮譽版主 (文壇精英)

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dhd997(金幣+1):鼓勵一下。 2010-10-20 13:41:40

可以分為原理，開發(fā)，應(yīng)用

原理一般就是各種算法，這些基本是學(xué)數(shù)學(xué)的和計算機的搞

開發(fā)，就是編程，開發(fā)軟件或工具，計算機或數(shù)學(xué)的

應(yīng)用，就是用別人的軟件，這個是學(xué)生物的強項

你就負責(zé)用就行，初學(xué)者從primer dnaman NCBI在線軟件等簡單工具學(xué)期即可

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5樓2010-10-20 12:55:06

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thinkingers

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amisking(金幣+3):非常歡迎交流！ 2010-10-20 20:17:38

引用回帖:

Originally posted by reasonspare at 2010-10-20 09:02:21:

建議摟主，回頭好好的補一補生物信息學(xué)，不管你作為不作為你的主打方向，都是有好處的：

生物信息學(xué)，是一個很系統(tǒng)的東西，也是一個很有用的東西。除了每天去genbank，意外你還要多事情要做：
我只給你 ...

這個回復(fù)。。。顯得有點了解，我也只是上學(xué)期專業(yè)必修課學(xué)了生物信息學(xué)，不過那東西。。。聽不太懂，而且我興趣也不在此，不過搞這個的話計算機得要好，不光日常應(yīng)用，還有說的編程----我想這應(yīng)該是成為大牛，甚至泰斗的一個良好條件，不要總想著別人給你編好，自己動手，需要什么可以直接添加，這樣的話多熟悉熟悉linux是相當(dāng)不錯的。

另外再頂這個，LZ多體會體會，請教請教

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6樓2010-10-20 17:59:25

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iaminxanadu

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只記�。喝魏畏较蚨际莻€“有用的”潛力巨大的。關(guān)鍵是是不適合，勝任否？導(dǎo)師一點幫不上，自己又很菜只能隨實驗室主流了

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7樓2010-11-05 13:46:32

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holyala

木蟲 (著名寫手)

磚家

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引用回帖:

灰常好啊~~詳細生動！
生物信息學(xué)絕對是現(xiàn)代生物科研的重要工具，堪比分子生物學(xué)啊~~很好的方向！

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8樓2010-11-05 13:56:14

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364602sanwen

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有網(wǎng)站地址么？

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韓國有一家網(wǎng)站，整理了Genbank里所有的16S rDNA,然后進行系統(tǒng)命名，我們都知道如果想知道一個細菌是那個種，必須要知道16S.換句話說你拿到你的菌株16S 就可以去他的網(wǎng)站比對了。

有網(wǎng)站地址么？

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9樓2010-11-05 14:44:43

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602059625

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亂七八糟，搞個名字嚇?biāo)廊耍?

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[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=填寫姓名&say=這里填寫您想說的內(nèi)容。[/img][/url]

10樓2010-11-05 15:47:50

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