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ice_rain鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】關(guān)于vasp進(jìn)行分子動力學(xué)模擬的求助
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我對分子動力學(xué)一點(diǎn)也不了解，就想模擬一下氧化表面小分子的動力學(xué)行為。（不知道表述清楚不）遇到問題如下 1.POSCAR 中加上Selective dynamics， 除了標(biāo)記是做動力學(xué)模擬之外，是否有固定原子的作用。 2.由于是氧化表面，分子的吸附對表面影響不是很大，如果能固定個別原子，是否能只讓吸附分子進(jìn)行優(yōu)化。或者讓一個top layer也relax 3.關(guān)于模擬時間的問題，我沒有做過動力學(xué)模擬的測試，一般的100多個原子的體系，1000步，動力學(xué)要用多少時間（CPU時間）（問題很弱，主要權(quán)衡時間和效果，有沒有必要進(jìn)行計算）。關(guān)于模擬體系的時間問題，如果是水分子，大約多少ps合適，或者多少步合適。 目前想到這些問題。謝謝大家的幫助。 |
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yyx19840628
木蟲 (著名寫手)
鷹的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
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7樓2010-10-27 09:22:59
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