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[交流]
【求助/交流】引物及PCR產(chǎn)物連入載體的問題求助。!
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今天看文獻(xiàn)遇到點(diǎn)問題不太明白,請(qǐng)教大家: 1,設(shè)計(jì)一對(duì)引物擴(kuò)增某基因,引物如下:, 5‘-GCGGCGGAATTCATGGCTAG TATCAAACAAATAG-30’ containing the ATG start codon, introduced an EcoRI restriction site (underlined), and the carboxyl terminal primer 50-GCGGCG TCTAGATCACTTGA CCCTGAGTCTTC-30, including the stop codon, introduced an XbaI restriction site. 問題:起始密碼子和終止密碼子前面均引入酶切位點(diǎn)序列,但是酶切位點(diǎn)序列前面的一段序列是用來做什么用的?(GCGGCG)。此外,引物的退火溫度計(jì)算的時(shí)候是按照序列全長(zhǎng)計(jì)算?or按照酶切位點(diǎn)后的序列計(jì)算? 2。加入酶切位點(diǎn)后的引物擴(kuò)增出來序列是否粘性末端?能否直接連入T-載體?本文實(shí)驗(yàn)方法中說擴(kuò)增結(jié)果純化后直接連入pGME-T載體,然后轉(zhuǎn)到E.coli DH5a中去測(cè)序。T載體不是末端為一個(gè)T堿基的粘性末端嗎,PCR結(jié)果必須是多一個(gè)A堿基的粘性末端才能連接上(本人理解)按照我這樣的理解,解釋不了文中直接將產(chǎn)物連接到載體中,望高人解疑。! |
木蟲 (正式寫手)
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據(jù)我所知,對(duì)你問題的解答如下: 1.你提到的酶切位點(diǎn)前面的序列是保護(hù)堿基,一般3-4個(gè),你這個(gè)有點(diǎn)多,但性質(zhì)是保護(hù)堿基,保護(hù)酶切位點(diǎn),因?yàn)樵谀┒巳菀捉到、丟失 2.PCR之后的序列就可以連上T載體啊,怎么可能是粘性末端呢?3‘端有A重復(fù)是taq酶的特性,所以才有TA克隆這項(xiàng)技術(shù)。你TA克隆后再去酶切,因?yàn)槟阍谝锢镆呀?jīng)設(shè)計(jì)了酶切位點(diǎn),(個(gè)人覺得,設(shè)計(jì)的酶切位點(diǎn)應(yīng)該不能和T載體上的酶切位點(diǎn)重復(fù)),酶切后才有粘性末端,再和同樣酶酶切的載體質(zhì)粒(酶切后是線性的)連接,重組質(zhì)粒再轉(zhuǎn)化大腸。就好了 希望有所幫助 |
木蟲 (正式寫手)
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