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panwenxiao金蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
【求助】PM3優(yōu)化出錯(cuò)：Incomplete coordinate system.
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用PM3計(jì)算兩個(gè)分子的相互作用，已經(jīng)跑了28個(gè)點(diǎn)了，報(bào)錯(cuò)結(jié)束： GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad Berny optimization. SLEqS1 Cycle: 5071 Max:0.538619E-09 RMS:0.391054E-10 Conv:0.227262E-10 Incomplete coordinate system. Try restarting with Geom=Check Guess=Read Opt=(ReadFC,NewRedundant) Incomplete coordinate system. Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g03/l103.exe at Wed Nov 10 03:33:30 2010. Job cpu time: 0 days 0 hours 46 minutes 2.3 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 47 Int= 0 D2E= 0 Chk= 30 Scr= 1 不知道是什么原因，還請(qǐng)各位高手幫忙解決一下！急！ |
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panwenxiao
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4樓2010-11-15 11:01:08
ykwang
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2樓2010-11-13 21:57:59
qzhaosdu
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panwenxiao(金幣+1):謝謝參與
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轉(zhuǎn)自CCL： http://ftp.ccl.net/chemistry/res ... .003-dir/index.html Hi Adlane, The error message indicates that the transformation of Cartesian forces to internals did not converge (for semiempiricals, the "large molecular" iterative transformations are used by default, Opt=Small changes that but may need more memory and much more CPU time, but no guarantee that it solves the original problem). This usually means that due to changes in the molecular geometry the initially built redundant internal coordinate system should be changed. Building up a new coordinate system usually helps in such situations (the error message gives this advice). If the error message came in the first optimization cycle or the adviced restart did not solve the problem than the internal coordinates should be examined and some manual modifications can help. If you think that the automatically generated coordinate system should be manually changed please add some trivial H-bonds or send me the structure directly and hopefully I can make the necessary changes. For testing the coordinate system you can use an MM optimization with the Opt=Large option. Best wishes, Ödön |
5樓2010-11-15 11:09:16
ykwang
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6樓2010-11-15 11:24:42
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