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zxyjenny6新蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】pcr、酶切問題,急! 已有1人參與
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各位蟲蟲,緊急求助! 構(gòu)建重組質(zhì)粒,做了半年多的實驗,還是一點進展沒有,最近又遇到一些新問題: 1。 pcr不穩(wěn)定,或出現(xiàn)雜帶或P不出來。我用的是高保真的酶,之前一段時間p出來都很穩(wěn)定,(先配大的體系然后分裝成25的體系去p)只有一特異性條帶。但最近做的時候如果是配成大體系再分裝就會p不出來(可以確定加的試劑和量絕對不錯,與以前一樣),只配25的就能p出來,不過條帶有兩條,一條很亮,這條亮的條帶很近的下方可以看到另一條帶,較弱,但是很特異,而且跟那個亮的大小差不了多少,這是為什么? 2。 質(zhì)粒雙酶切跑膠,在比預(yù)期大小要小的位置出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,并且加樣孔稍有殘留,是什么原因?酶切時間是4個小時,體系是20,各加了1的酶。之前用這個體系相同時間酶切質(zhì)粒都能得到大小符合要求的線性的結(jié)果,這次有所不同的是換了個提質(zhì)粒的試劑盒,提的質(zhì)粒量要比以前亮的多。是因為載體過多沒有切完全還是因為質(zhì)粒沒提好、混有雜質(zhì)? 3。 pcr產(chǎn)物割膠回收以后酶切出現(xiàn)多條帶,最亮的條帶下有較弱的特異性條帶,并且靠得很近,單靠marker也分辨不出來哪條才是目的條帶。以前也是相同的條件只有一條條帶的。操作中應(yīng)該也不可能污染到其他的雜質(zhì)。不知道為什么出現(xiàn)這種情況,望高手指教! 做了這么久,突然出現(xiàn)這種問題,十分著急,求助! |
榮譽版主 (知名作家)
大洪
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1。 pcr不穩(wěn)定,或出現(xiàn)雜帶或P不出來。我用的是高保真的酶,之前一段時間p出來都很穩(wěn)定,(先配大的體系然后分裝成25的體系去p)只有一特異性條帶。但最近做的時候如果是配成大體系再分裝就會p不出來(可以確定加的試劑和量絕對不錯,與以前一樣),只配25的就能p出來,不過條帶有兩條,一條很亮,這條亮的條帶很近的下方可以看到另一條帶,較弱,但是很特異,而且跟那個亮的大小差不了多少,這是為什么? 答:(1)什么大體系分到小體系PCR不出是不可能的,只有可能是你分裝的過程中的試劑盒手法出現(xiàn)點問題,排查一下吧。 (2)那是影子帶,常常出現(xiàn),加入一定量的輔助劑有助于解決這個問題如BSA,Triton-X100,等等,具體可以查看《分子克隆實驗指南》一書。 |

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