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【求助】納米管問(wèn)題
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各位高手： 我現(xiàn)在在算藥物分子與納米管相互作用，納米管算的時(shí)候用的是超晶包，藥物-納米管復(fù)合物也是超晶包，那么單獨(dú)的藥物分子計(jì)算時(shí)也需要把藥物分子放在超晶包中計(jì)算嗎？我看文獻(xiàn)上算氣體分子在納米材料上吸附時(shí)，納米管，納米管-氣體分子復(fù)合物都是放在晶包里算的，可是單獨(dú)的氣體分子沒有放在晶包中。那么到底需不需要放��？因?yàn)槿绻环潘褪欠侵芷诘�，而其它的建了晶包的是周期性的啊。希望高手指點(diǎn)下，謝謝！ |
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3樓2010-11-17 17:42:10
4樓2010-11-17 23:02:27
5樓2010-11-17 23:05:25
6樓2010-11-18 09:57:35
★ ★ ★ ★
youzhizhe(金幣+2):謝謝交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金幣+2):謝謝交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金幣+1):謝謝 2010-11-18 17:55:26
youzhizhe(金幣+2):謝謝交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金幣+2):謝謝交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金幣+1):謝謝 2010-11-18 17:55:26
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我也是做CTN的。 看樣子你是想先把結(jié)合起來(lái)的E算出來(lái)，再把單獨(dú)的算出來(lái)，然后相減來(lái)算它們的結(jié)合能吧，這樣的話，你在計(jì)算單獨(dú)（也就是分開的時(shí)候單個(gè)的）能量時(shí)，各自考慮各自的。晶胞的大小與碳納米管的大小無(wú)關(guān)，你現(xiàn)在是要算單獨(dú)的一個(gè)分子具有的能量，只要你取的晶胞大點(diǎn)，保證計(jì)算出來(lái)的能量是單個(gè)分子的就行（晶胞選得大點(diǎn)，保證周期性的情況下，其它相鄰的分子與你算的分子沒有相互作用）了。 正常來(lái)說(shuō)的話，選取碳納米管大小也足夠了，因?yàn)镃NT晶胞的大小我們也是測(cè)試出來(lái)的。可以保證超晶胞中相鄰兩個(gè)分子之間沒有相互作用。 我用的是VASP，因?yàn)樵赩ASP里計(jì)算能量必須用周期性結(jié)構(gòu)，計(jì)算單個(gè)分子也只能通過(guò)空位層來(lái)解決。我不太了解你用的軟件，如果DMOL軟件計(jì)算能量也是用周期結(jié)構(gòu)的話就是我上面說(shuō)得，如果可以計(jì)算單個(gè)分子的能量就請(qǐng)高師們指點(diǎn)一下吧。 |
7樓2010-11-18 11:11:50
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