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[交流]
【求助】納米管問題
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各位高手： 我現(xiàn)在在算藥物分子與納米管相互作用，納米管算的時候用的是超晶包，藥物-納米管復(fù)合物也是超晶包，那么單獨的藥物分子計算時也需要把藥物分子放在超晶包中計算嗎？我看文獻上算氣體分子在納米材料上吸附時，納米管，納米管-氣體分子復(fù)合物都是放在晶包里算的，可是單獨的氣體分子沒有放在晶包中。那么到底需不需要放啊？因為如果不放它就是非周期的，而其它的建了晶包的是周期性的啊。希望高手指點下，謝謝！ |
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youzhizhe(金幣+2):謝謝交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金幣+2):謝謝交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金幣+1):謝謝 2010-11-18 17:55:26
youzhizhe(金幣+2):謝謝交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金幣+2):謝謝交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金幣+1):謝謝 2010-11-18 17:55:26
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我也是做CTN的。 看樣子你是想先把結(jié)合起來的E算出來，再把單獨的算出來，然后相減來算它們的結(jié)合能吧，這樣的話，你在計算單獨（也就是分開的時候單個的）能量時，各自考慮各自的。晶胞的大小與碳納米管的大小無關(guān)，你現(xiàn)在是要算單獨的一個分子具有的能量，只要你取的晶胞大點，保證計算出來的能量是單個分子的就行（晶胞選得大點，保證周期性的情況下，其它相鄰的分子與你算的分子沒有相互作用）了。 正常來說的話，選取碳納米管大小也足夠了，因為CNT晶胞的大小我們也是測試出來的�？梢员ＷC超晶胞中相鄰兩個分子之間沒有相互作用。 我用的是VASP，因為在VASP里計算能量必須用周期性結(jié)構(gòu)，計算單個分子也只能通過空位層來解決。我不太了解你用的軟件，如果DMOL軟件計算能量也是用周期結(jié)構(gòu)的話就是我上面說得，如果可以計算單個分子的能量就請高師們指點一下吧。 |
7樓2010-11-18 11:11:50
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3樓2010-11-17 17:42:10
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