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[交流]
【求助】請教CASTEP過渡態(tài)里面如何消除虛頻？
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請問，用CASTEP作過渡態(tài)搜索的時候，虛頻該如何消除呢？我算了幾個過渡態(tài)，都有兩到三個比較大的虛頻（用phonon計算的，看G點的頻率，請見附圖），2500i 500i 350i這樣大小的。網(wǎng)上很多Guassian消除虛頻的文章，那CASTEP該如何消虛頻呢？ 在網(wǎng)上看到，大家用這種方法在Gaussian里消虛頻：“虛頻振動坐標加和乘以系數(shù)加到相應的原子坐標上去”，請教，這里面相應的原子坐標是指反應物的還是過渡態(tài)的原子坐標？加完之后，繼續(xù)優(yōu)化。是否是指對過渡態(tài)進行構(gòu)型優(yōu)化；還是指加到反應物坐標后，對其進行構(gòu)型優(yōu)化，再次搜索過渡態(tài)？不勝感激。 求指點，在這點上卡了很久了……   2500i的振動如下     [ Last edited by 04nylxb on 2010-12-2 at 12:10 ] |
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3樓2010-11-24 15:19:48
4樓2010-12-01 08:45:40
★ ★ ★
youzhizhe(金幣+3):謝謝參與交流。 2010-12-01 21:26:24
04nylxb(金幣+5):收到非常感謝，我把信息給出 2010-12-01 22:23:05
youzhizhe(金幣+3):謝謝參與交流。 2010-12-01 21:26:24
04nylxb(金幣+5):收到非常感謝，我把信息給出 2010-12-01 22:23:05
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最好把三個的在震動模式給出來 感覺，過渡態(tài)的虛頻跟一般穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的虛頻還不大一樣， 建議：希望把三個虛頻的詳細信息給出（哪個官能團的，如何振動的）， 1，重新搜索下呢。（估計不行）。 2，如果不行的話，加大一點力的收斂精度。 3，把過渡態(tài)的虛頻的那幾個原子固定了，然后只優(yōu)化那部分不需要的虛頻的原子。然后再優(yōu)化下所有的原子 |
5樓2010-12-01 21:25:22
6樓2010-12-01 22:32:52
7樓2010-12-02 09:07:16
8樓2010-12-02 12:12:24
9樓2010-12-02 12:37:48
10樓2010-12-02 12:53:05
11樓2010-12-02 13:05:44
★ ★
04nylxb(金幣+1):收到，非常感謝 2010-12-02 16:48:34
youzhizhe(金幣+2):謝謝交流。 2010-12-03 01:32:58
04nylxb(金幣+1):收到，非常感謝 2010-12-02 16:48:34
youzhizhe(金幣+2):謝謝交流。 2010-12-03 01:32:58
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呵呵，謝謝樓主的回答和金幣。一般來說是這樣的，既然數(shù)值找到的過度態(tài)，人為就不要去改變它了，不然就變成非過度態(tài)了。除非搜索方法不好，這時建議用NEB方法+較高的力收斂判據(jù)。在過度態(tài)比較準確找到的前提下，出現(xiàn)一些不高的虛頻，很可能是： （1）電子自恰計算精度不高。因為振動頻率的計算在收斂精度上要比總能來得苛刻。 （2）計算超原包太小導致neighbouring images之間的較小的相互作用會，從而出現(xiàn)一些意外的虛頻。（我看樓主的超原胞好像較小，不知道夠大了乎？） 祝：好運！  [ Last edited by lfhuang on 2010-12-2 at 16:28 ] |
12樓2010-12-02 16:26:31
13樓2010-12-02 16:51:13
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17樓2012-03-08 13:57:37
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