 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (3462)
- >考研 (383)
- >導(dǎo)師招生 (367)
- >文獻(xiàn)求助 (153)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (138)
- >基金申請(qǐng) (115)
- >休閑灌水 (75)
- >論文投稿 (54)
- >教師之家 (52)
- >考博 (50)
- >招聘信息布告欄 (45)
- >碩博家園 (35)
- >論文道賀祈福 (27)
- >博后之家 (26)
- >留學(xué)生活 (26)
- >無(wú)機(jī)/物化 (22)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 5154 | 回復(fù): 10 | |||
niuxiaoqi721銅蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
過(guò)渡態(tài)消除虛頻
|
||
| 過(guò)渡態(tài)收索出來(lái)以后，發(fā)現(xiàn)有兩個(gè)虛頻。一個(gè)一千多，一個(gè)一百多，怎樣才能消除小的那個(gè)，看到有人用要消除的虛頻*0.1-0.3加到原來(lái)的坐標(biāo)上，可是不知道具體操作步驟，這里請(qǐng)高人指導(dǎo)，越詳細(xì)越好。萬(wàn)分感謝，還有就是本人使用的是Dmol |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 過(guò)渡態(tài)計(jì)算 |
» 猜你喜歡
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿中國(guó)海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
280求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑 ，六級(jí)已過(guò)，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
工科材料085601 279求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
070300化學(xué)319求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
生物學(xué)071000 329分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 請(qǐng)問(wèn) 能否在溶劑中只算過(guò)渡態(tài)單點(diǎn)能的情況下 把虛頻消掉？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- qst3找過(guò)渡態(tài)和設(shè)想結(jié)果一樣但是沒(méi)有虛頻
已經(jīng)有9人回復(fù)
- slab表面小分子反應(yīng)，如何驗(yàn)算過(guò)渡態(tài)的虛頻？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 高斯計(jì)算過(guò)渡態(tài)時(shí)的能壘總是負(fù)值
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助】重金：過(guò)渡態(tài)，三個(gè)虛頻！
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 【求助】dmol3 過(guò)渡態(tài)消虛頻！！
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于Dmol3中消去過(guò)渡態(tài)的虛頻��！急��！
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教CASTEP過(guò)渡態(tài)里面如何消除虛頻？
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助】dmol 計(jì)算過(guò)渡態(tài)出現(xiàn)兩虛頻
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】過(guò)渡態(tài)出現(xiàn)2個(gè)虛頻
已經(jīng)有10人回復(fù)
gongxd325
至尊木蟲(chóng) (文壇精英)
- 應(yīng)助: 177 (高中生)
- 金幣: 37750.1
- 散金: 13187
- 紅花: 109
- 帖子: 34003
- 在線: 1844.8小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 233962
- 注冊(cè): 2006-03-30
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2012-02-20 13:50:40
xiaoboy185
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 788
- 散金: 248
- 紅花: 3
- 帖子: 702
- 在線: 472.3小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 481831
- 注冊(cè): 2007-12-19
- 專業(yè): 函數(shù)論
3樓2012-02-20 19:13:18
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227(金幣+2): 感謝交流，有幫助 2012-02-21 08:37:09
WDD880227(金幣+2): 感謝交流，有幫助 2012-02-21 08:37:09
| 你有用過(guò)TS optimization嗎？這個(gè)功能就是解決你這個(gè)問(wèn)題的，消除多余的虛頻模，原理和二樓說(shuō)的小工具差不多，只不過(guò)在MS里面自動(dòng)完成了。DMol3默認(rèn)情況下會(huì)自動(dòng)選擇頻率最低的模作為由反應(yīng)物指向產(chǎn)物的振動(dòng)模，保留下來(lái)，而將其他的虛頻模優(yōu)化掉，當(dāng)然，你也可以自己添加Key words：Opt_TS_Mode，選擇需要保留的模，也就是你認(rèn)為由反應(yīng)物指向產(chǎn)物的振動(dòng)模，這個(gè)�？梢圆皇穷l率最低的模，譬如你提到的頻率是負(fù)幾十個(gè)波數(shù)的模。 |
4樓2012-02-20 22:47:47
niuxiaoqi721
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 138.7
- 散金: 2
- 紅花: 1
- 帖子: 222
- 在線: 105小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1226906
- 注冊(cè): 2011-03-09
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
5樓2012-02-21 08:58:46
【答案】應(yīng)助回帖
liliangfang(金幣+2): 多謝回帖交流 2012-02-21 11:07:04
| 差別大并不能說(shuō)明有問(wèn)題，關(guān)鍵是看優(yōu)化完了，是否滿足唯一虛頻，且其振動(dòng)由反應(yīng)物指向產(chǎn)物。我覺(jué)得你完全可以試試TS optimization，坦率地說(shuō)，消虛頻沒(méi)有什么特別好的方法，都是按照其振動(dòng)方式微調(diào)原子位置，TS optimization也基本就是這個(gè)原理，所以說(shuō)某種方法更準(zhǔn)確沒(méi)什么太多道理，而且，TS optimization還方便，過(guò)渡態(tài)的優(yōu)化還不比結(jié)構(gòu)優(yōu)化，后者是要把所有的虛頻模都消掉，而過(guò)渡態(tài)還得保留你需要的虛頻模，所以調(diào)整起來(lái)更麻煩。此外，過(guò)渡態(tài)結(jié)構(gòu)唯一嗎？算出來(lái)的唯一虛頻模的頻率是負(fù)1000波數(shù)，合理，如果稍微調(diào)整一下原子位置，變成負(fù)500波數(shù)也完全可能，按照我們目前判斷過(guò)渡態(tài)的依據(jù)，兩者都合理。 |
6樓2012-02-21 10:13:34
sch
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 51.3
- 帖子: 40
- 在線: 19.6小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 269709
- 注冊(cè): 2006-08-05
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227(金幣+1): 感謝交流提示 2012-02-22 10:37:56
賀儀(金幣+1): 謝謝參與討論 2012-02-22 11:13:06
WDD880227(金幣+1): 感謝交流提示 2012-02-22 10:37:56
賀儀(金幣+1): 謝謝參與討論 2012-02-22 11:13:06
| 在你計(jì)算的Gaussian輸出文件里，找到虛頻為負(fù)的一百多下面的那套直角坐標(biāo)，x,y,z分別*0.1-0.3（或直接）分別對(duì)應(yīng)加到你原來(lái)輸入文件的直角坐標(biāo)上，產(chǎn)生一套新的坐標(biāo)，作為輸入文件即可。我試過(guò)，有時(shí)候管用，能消掉多余的那個(gè)虛頻。 |
7樓2012-02-22 10:34:40
niuxiaoqi721
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 138.7
- 散金: 2
- 紅花: 1
- 帖子: 222
- 在線: 105小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1226906
- 注冊(cè): 2011-03-09
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
8樓2012-02-23 09:53:27
aa644387857
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 171.1
- 散金: 170
- 紅花: 3
- 帖子: 204
- 在線: 117.2小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1347536
- 注冊(cè): 2011-07-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)
9樓2013-03-21 10:29:15
yn1107
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 528.5
- 帖子: 10
- 在線: 11.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 3147129
- 注冊(cè): 2014-04-18
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
多謝了！ 10樓2015-03-31 14:33:50
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 niuxiaoqi721 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 298-一志愿中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑 +4 | 手機(jī)用戶 2026-03-17 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考博] 環(huán)境領(lǐng)域全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名 +3 | QGZDSYS 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +4 | △小透明* 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085601求調(diào)劑 +4 | Du.11 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0854可跨調(diào)劑，一作一項(xiàng)核心論文五項(xiàng)專利，省、國(guó)級(jí)證書(shū)40+數(shù)一英一287 +3 | 小李0854 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽(yáng)花天天開(kāi)心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 求老師收留調(diào)劑 +4 | jiang姜66 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 070305求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工 323 英一+數(shù)二+物化，一志愿：哈工大 本人本科雙一流 +4 | 自由的_飛翔 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 【0703化學(xué)調(diào)劑】-一志愿華中師范大學(xué)-六級(jí)475 +5 | Becho359 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 +5 | 隔壁陳先生 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料科學(xué)與工程/總分295/求收留 +9 | 2026調(diào)劑俠 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 冬十三 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 【考研調(diào)劑求收留】 +3 | Ceciilia 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +6 | Liyouyumairs 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 工科調(diào)劑 +4 | Jiang191123！ 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | 李政瑩 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑（食品/專碩） +3 | xc321 2026-03-12 | 6/300 |
|