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suny2005木蟲 (小有名氣)
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[交流]
【討論】g_density命令問題
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| 最近做了一個(gè)兩相體系的動(dòng)力學(xué)模擬，我想用g_density命令分析一下兩種物質(zhì)的密度分布，所以用到了下面的命令g_density -f xx.xtc -s xx.tpr -n index.ndx -dens number -o dens.xvg。其中用-dens number主要是想獲得兩種分子的數(shù)量密度，但分析結(jié)束后發(fā)現(xiàn)結(jié)果好像不對(duì)，因?yàn)槲业捏w系中兩種分子的數(shù)量是相等的，如果分成兩相的話，他們的數(shù)量密度也應(yīng)當(dāng)是相等的，但結(jié)果并不是這樣，有人知道這是為什么嗎？ |
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