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小名阿飛

銀蟲 (初入文壇)

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[交流] AMOVA分子方差分析SSR數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)怎么導(dǎo)入？求高手幫助

我現(xiàn)在在處理SSR數(shù)據(jù)，需要做一個AMOVA分析，用的是arlequin31軟件，但是現(xiàn)在不會導(dǎo)入數(shù)據(jù)，請哪位高手指點。謝謝！

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1樓 2010-11-26 10:31:21

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小名阿飛

銀蟲 (初入文壇)

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恩，往TXT里存這個我知道，主要是存的是什么數(shù)據(jù)的��？是存等位基因的頻率？還是什么的？
[Profile]
  Title="A small example of microsatellite data"
NbSamples=4
GenotypicData=1
  #Unknown gametic phase between the 12 loci
GameticPhase=0
DataType=MICROSAT
LocusSeparator=WHITESPACE
[Data]
  [[Samples]]
SampleName="MICR1"
SampleSize=28
SampleData=  {
Genot1  27  12 23 17
            13 22 16
Genot2  1  15 22 16
            13 22 16
}
SampleName="MICR2"
SampleSize=59
SampleData=  {
Genot3  37  12 24 18
            12 22 16
Genot4  1  15 20 18
            13 22 18
Genot5  21  14 22 16
            14 23 16
}
SampleName="MICR3"
SampleSize=30
SampleData=  {
Genot6  17  12 21 16
            13 22 15
Genot7  1  12 20 16
            13 23 16
Genot8  12  10 22 15
            12 22 15
}
SampleName="MICR4"
SampleSize=16
SampleData=  {
Genot9  15  13 24 16
            13 23 17
Genot10 1 12 24 16
            13 23 16
}
[[Structure]]
  StructureName="Test microsat structure"
NbGroups=2
  #The first group is made up of the first 2 samples
Group={
"MICR1"
"MICR2"
   }
#The last 2 samples will be put into the second group
Group={
"MICR3"
"MICR4"
有這么個模板，但是不知道上面的數(shù)字我該用什么來換

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4樓2010-11-28 21:46:32

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dunqudey

禁蟲 (正式寫手)

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2樓2010-11-26 10:54:53

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xinfengy

鐵桿木蟲 (正式寫手)

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蟲號: 461647

把數(shù)據(jù)存成.txt在往里導(dǎo)。

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3樓2010-11-26 11:03:43

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passingby

銅蟲 (小有名氣)

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帖子: 100
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蟲號: 1292193

我也有這方面的疑問，和你共同期待解答

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5樓2012-05-04 16:55:42

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