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crystal0714金蟲 (小有名氣)
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【求助】用Gaussview畫分子軌道圖和數(shù)據(jù)分析的結(jié)果不一致的問題 已有7人參與
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我在用gaussian03里面的加電場計算Cu金屬串配合物，采用B3LYP方法，混合基組，在加電場到0.015a.u.時，用Gaussview看優(yōu)化后的LUMO分子軌道圖時，軌道圖顯示的幾乎沒有電子云分布。 然后，我就改變了下isovalue的值，從-0.01-0.01，就只有一些電子云分布在非金屬外邊。 問題是，我在log文件中分析的各個原子對LUMO軌道的貢獻(xiàn)，得出的結(jié)果是99%的貢獻(xiàn)都是來自于金屬，也就是說從數(shù)據(jù)分析的結(jié)論和分子軌道圖形的結(jié)果不一致。而且，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的LUMO軌道主要分布在Cu的5s(3.95)、6s(6.92)、和11pz(5.08)上面。 請問大俠們， （1）會不會是有電子分部在11pz這樣太外層的軌道上而導(dǎo)致的分子軌道圖幾乎看不到什么電子云？ （2）能有什么辦法能畫出和數(shù)據(jù)一致的主要分布在金屬上的分子軌道圖嗎？ |
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2樓2010-12-01 21:26:11
gengle
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3樓2010-12-01 23:48:29
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我覺得，沒有不一致的問題。 你用Gaussview看優(yōu)化后的LUMO分子軌道圖時，因為LUMO是空軌道，當(dāng)然軌道圖顯示的幾乎沒有電子云分布。 當(dāng)你分析各個原子對LUMO軌道的貢獻(xiàn)，這時是設(shè)想這個空軌道如果有電子占據(jù)時當(dāng)情形，如激發(fā)態(tài)，得出的結(jié)果是99%的貢獻(xiàn)都是來自于金屬，當(dāng)然也是對的。 如果一定要看這個LUMO的電子云分布，可以將fch數(shù)據(jù)讀入multiwfn，只對這個LUMO作電子密度cub文件，multiwfn可以顯示它的三維圖像。 |
4樓2010-12-02 08:24:11
liguanghua 
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您好！我想算分子軌道貢獻(xiàn)。 In order to define the atoms which comprise a group, a file, gausssum2.1/groups.txt, should be created with a format similar to the following: Ru 1 bpy1 2-11,14,17,22,27,34-35,42-43,50,57 bpy2 12,16,18-19,25-26,28-30,39-41,44-46,54-56,58,61 bpy3 13,15,20-21,23-24,31-33,36-38,47-49,51-53,59-60 如何按照這種格式寫呢。沒有看懂這種格式。請賜教！感激不盡！ |
5樓2010-12-02 10:51:46
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7樓2010-12-06 08:23:53
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