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cenwanglai

禁蟲(chóng)

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[交流] 【求助完畢】vasp-slab-邊界附近原子頂位吸附小分子的結(jié)構(gòu)優(yōu)化很難收斂嗎？

我的表面是p(3*3)大小的，在表面中間吸附、摻雜都能100步內(nèi)收斂。但是在靠近邊界的最表層原子頂位上的吸附（如吸附SO2）結(jié)構(gòu),力就很難收斂，都300多步了，而且能量在小數(shù)點(diǎn)后第三位上上下波動(dòng)。

同樣在邊界附近去掉一個(gè)最表層原子（O），做一個(gè)空位結(jié)構(gòu)，也能較快收斂。但同一系列的自洽計(jì)算（ISMEAR=0,SIGMA=0.05）,scf的EENTRO~=.03。一般中間缺陷或者吸附結(jié)構(gòu)在scf計(jì)算中第六電子步就是0.0000了。

問(wèn)題：
（1）邊界上的缺陷和吸附結(jié)構(gòu)優(yōu)化有什么要注意的呢？
（2）要增大表面大小，把邊界外推，讓吸附結(jié)構(gòu)靠近表面中心？
（3）超胞結(jié)構(gòu)優(yōu)化（cell fixed)邊界與表面中心的處理不一樣嗎？

[ Last edited by cenwanglai on 2011-4-25 at 20:13 ]

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1樓 2010-12-13 16:17:55

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★
sunyang1988(金幣+1):謝謝交流 2010-12-14 09:17:37
cenwanglai(金幣+2):是氧化物表面。中間是有雜原子的。除此之外，沒(méi)有差別。雜原子對(duì)表面有一定扭曲。 2010-12-14 11:28:57

氧化物表面么？

能確定邊界和中心的環(huán)境是一樣的么？

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4樓2010-12-14 09:16:14

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bingmou

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zzy870720z(金幣+2):鼓勵(lì)交流 2010-12-13 22:59:04

如果有圖會(huì)比較容易理解，你的表面是周期邊界條件的嗎？邊界是指在cell的邊界處嗎？
按我的理解，在邊界處的計(jì)算應(yīng)該和中心計(jì)算沒(méi)有太多的區(qū)別，唯一可能的原因就是原子一離開(kāi)cell就會(huì)做一個(gè)加法或減法回到cell，這種加法減法可能會(huì)導(dǎo)致誤差。
頂位的吸附也是一個(gè)問(wèn)題，有可能會(huì)有多個(gè)暫穩(wěn)態(tài)使得原子在多個(gè)暫穩(wěn)態(tài)之間跳躍

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2樓2010-12-13 21:09:26

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引用回帖:

Originally posted by bingmou at 2010-12-13 21:09:26:
如果有圖會(huì)比較容易理解，你的表面是周期邊界條件的嗎？邊界是指在cell的邊界處嗎？
按我的理解，在邊界處的計(jì)算應(yīng)該和中心計(jì)算沒(méi)有太多的區(qū)別，唯一可能的原因就是原子一離開(kāi)cell就會(huì)做一個(gè)加法或減法回到cell， ...

是周期性邊界條件。你完全明白了我的問(wèn)題所在。

我的POTIM調(diào)到0.1了。是不是可以再調(diào)小一點(diǎn)？

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3樓2010-12-14 09:10:04

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zzy870720z(金幣+2):謝謝指教 2010-12-14 09:33:26
cenwanglai(金幣+2):表面被吸附的小分子受力無(wú)法收斂。其它結(jié)構(gòu)能很好的收斂到0.02.邊界附近吸附勢(shì)只能到0.05. 2010-12-14 11:30:14

引用回帖:

Originally posted by cenwanglai at 2010-12-14 09:10:04:

是周期性邊界條件。你完全明白了我的問(wèn)題所在。

我的POTIM調(diào)到0.1了。是不是可以再調(diào)小一點(diǎn)？

我覺(jué)得你可以仔細(xì)研究是一下是哪些原子的力無(wú)法收斂，以及他們?yōu)槭裁丛谀抢餆o(wú)法收斂。POTIM已經(jīng)很小了，我覺(jué)得沒(méi)有必要修改，而且VASP在弛豫的過(guò)程中是修改POTIM的，如果發(fā)現(xiàn)不對(duì)會(huì)縮小POTIM，如果發(fā)現(xiàn)正確會(huì)加大POTIM

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5樓2010-12-14 09:24:01

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