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【求助】網(wǎng)上下載的蛋白-配基復(fù)合物，配基結(jié)構(gòu)不完整時(shí)怎么辦 已有1人參與
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我想分析自己合成的小分子和靶蛋白的結(jié)合模式與已知化合物結(jié)合模式的異同。 從網(wǎng)上下載下來了蛋白-已知化合物復(fù)合物的pdb文件，但是由于已知化合物的一部分化學(xué)基團(tuán)在蛋白活性口袋外，在pdb文件中沒有標(biāo)出這部分基團(tuán)，所以小分子結(jié)構(gòu)不完全。 如果要完成我的研究目的，我覺得應(yīng)該將這部分化學(xué)結(jié)構(gòu)補(bǔ)齊，但怎么在不影響復(fù)合物其他結(jié)合信息的情況下補(bǔ)齊化合物結(jié)構(gòu)，很是費(fèi)解，哪位同學(xué)幫下忙指導(dǎo)下，多謝了 |
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2樓2010-12-15 13:24:21
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