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[交流]
【求助】網(wǎng)上下載的蛋白-配基復合物,配基結構不完整時怎么辦 已有1人參與
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我想分析自己合成的小分子和靶蛋白的結合模式與已知化合物結合模式的異同。 從網(wǎng)上下載下來了蛋白-已知化合物復合物的pdb文件,但是由于已知化合物的一部分化學基團在蛋白活性口袋外,在pdb文件中沒有標出這部分基團,所以小分子結構不完全。 如果要完成我的研究目的,我覺得應該將這部分化學結構補齊,但怎么在不影響復合物其他結合信息的情況下補齊化合物結構,很是費解,哪位同學幫下忙指導下,多謝了 |
木蟲 (正式寫手)
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