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sss3012

銀蟲 (正式寫手)

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[交流] 【求助】MS安裝與計(jì)算

1：我們學(xué)校近來花費(fèi)50萬(wàn)購(gòu)買了曙光服務(wù)器，一共六個(gè)節(jié)點(diǎn)，每個(gè)節(jié)點(diǎn)有兩核，8顆2.66GHz的CUP, 這樣的配置運(yùn)算MS－CASTEP中100多個(gè)原子超晶胞或納米管結(jié)構(gòu)的幾何優(yōu)化任務(wù)是否能進(jìn)行，速度是否夠快（參數(shù)設(shè)置選FINE）？
2：我只在其中的一個(gè)節(jié)點(diǎn)上裝了MS,已經(jīng)可以運(yùn)行。如何使我把6個(gè)節(jié)點(diǎn)48個(gè)CPU全部調(diào)動(dòng)起來進(jìn)行運(yùn)算，能否給出一些具體建議？
3：我用機(jī)房中一臺(tái)WN系統(tǒng)的計(jì)算機(jī)調(diào)用服務(wù)器（LINUX系統(tǒng)red hat 4.7）進(jìn)行運(yùn)算，計(jì)算運(yùn)行后，是否有辦法可以關(guān)掉計(jì)算機(jī)而只讓服務(wù)器運(yùn)行但不影響我的計(jì)算，能否能給出一些合理化建議？
4：另外，我們目前發(fā)現(xiàn)主節(jié)點(diǎn)硬盤是滿的，無法啟動(dòng)Linux 的圖形界面，應(yīng)該刪除哪些目錄文件，能否也給出一些建議？謝謝各位兄弟姐妹的熱心幫助，我在這期待著你們回答。

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1樓 2010-12-16 20:07:27

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gongjijun

木蟲 (正式寫手)

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★
sunyang1988(金幣+1):謝謝交流 2010-12-16 22:54:23

一個(gè)u一萬(wàn)，這性價(jià)比也太低了點(diǎn)。

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2樓2010-12-16 21:00:42

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lbambool

木蟲 (著名寫手)

★ ★ ★
sunyang1988(金幣+3):謝謝幫助 2010-12-16 22:54:42

1.每個(gè)節(jié)點(diǎn)是兩顆四核的CPU吧？共8核*6節(jié)點(diǎn)計(jì)48核心，是這樣吧？從計(jì)算能力上來說沒有問題，但能計(jì)算多大的體系還有一個(gè)很重要的因素就是內(nèi)存，一般來說每核配4-8G內(nèi)存，如果每核4G那么，一個(gè)節(jié)點(diǎn)是32G，如果每核8G，一個(gè)節(jié)點(diǎn)是64G，內(nèi)存越大，能計(jì)算的體系越大，節(jié)點(diǎn)越多、主頻越高，計(jì)算的速度越快。
2.并行的安裝和單機(jī)稍有不同，你看一下幫助，要安裝的時(shí)候用非root用戶安裝，加--type cluster參數(shù)，另外，/tmp這個(gè)臨時(shí)交換文件夾最好設(shè)到非共享目錄下，使每臺(tái)機(jī)有自己的臨時(shí)目錄，這樣可以減少數(shù)據(jù)交換量，提高效率。
3.在windows上的MS客戶端上提交了任務(wù)后，客戶端MS是可以關(guān)掉甚至關(guān)機(jī)的，再開機(jī)打開MS會(huì)自動(dòng)提示你連接服務(wù)器上的計(jì)算任務(wù)，連上后會(huì)下載計(jì)算結(jié)果。
4.新系統(tǒng)主節(jié)點(diǎn)硬盤怎么會(huì)是滿的呢？如果真的是滿的建議你加塊硬般吧，沒多少錢，硬盤太滿的話影響效率并且容易造成硬盤損壞，數(shù)據(jù)丟了麻煩就大了。圖形界面和硬盤滿應(yīng)該是沒有關(guān)系，一般做服務(wù)器的系統(tǒng)的時(shí)候不選擇安裝圖形界面，你可以自己看一下，需要的話自己裝一個(gè)，或者換一塊新硬盤重裝個(gè)系統(tǒng)。

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3樓2010-12-16 22:47:00

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lbambool

木蟲 (著名寫手)

★
sunyang1988(金幣+1):謝謝交流 2010-12-16 22:55:07

引用回帖:

Originally posted by gongjijun at 2010-12-16 21:00:42:
一個(gè)u一萬(wàn)，這性價(jià)比也太低了點(diǎn)。

50萬(wàn)估計(jì)包括交換機(jī)兩部，機(jī)柜一個(gè)，UPS一個(gè)，這些5-10萬(wàn)了
不過總體來說，性價(jià)比是不高，我前段配了一臺(tái)雙路6核才4萬(wàn)元，12個(gè)核心，48G內(nèi)存，用起來已經(jīng)不錯(cuò)了。

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4樓2010-12-16 22:51:01

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gongjijun

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★
sunyang1988(金幣+1):謝謝交流 2010-12-16 22:58:03

引用回帖:

Originally posted by lbambool at 2010-12-16 22:51:01:

50萬(wàn)估計(jì)包括交換機(jī)兩部，機(jī)柜一個(gè)，UPS一個(gè)，這些5-10萬(wàn)了
不過總體來說，性價(jià)比是不高，我前段配了一臺(tái)雙路6核才4萬(wàn)元，12個(gè)核心，48G內(nèi)存，用起來已經(jīng)不錯(cuò)了。

你這個(gè)性價(jià)比稍好一些！這玩意真是太費(fèi)錢了。
有沒有試過自己配幾個(gè)單機(jī)組個(gè)集群試試，看性能差距大不大？

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5樓2010-12-16 22:55:42

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sunyang1988

至尊木蟲 (著名寫手)

★
youzhizhe(金幣+1):謝謝交流。 2010-12-16 23:11:00

花這么多錢曙光應(yīng)該提供一定的培訓(xùn)，你們要求實(shí)現(xiàn)的功能他們應(yīng)當(dāng)都給解決

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6樓2010-12-16 22:56:55

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lbambool

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★ ★
zzy870720z(金幣+2):謝謝分享經(jīng)驗(yàn) 2010-12-17 08:14:36

引用回帖:

Originally posted by gongjijun at 2010-12-16 22:55:42:

你這個(gè)性價(jià)比稍好一些！這玩意真是太費(fèi)錢了。
有沒有試過自己配幾個(gè)單機(jī)組個(gè)集群試試，看性能差距大不大？

幾年前還用4機(jī)PC組個(gè)小集群，4 核，各8G內(nèi)存，計(jì)算能力也挺強(qiáng)，16核，一共才2萬(wàn)，現(xiàn)在價(jià)還會(huì)便宜好多，如果地方夠大的話，搞PC集群性價(jià)比最高了。這幾臺(tái)PC計(jì)算能力和12核的服務(wù)器差不多，現(xiàn)在PC主板可以支持16G內(nèi)存了，4核16G 組集群是不錯(cuò)的選擇，以前在網(wǎng)上看有人不用機(jī)箱，用宜家的一個(gè)文件柜，看樣子一米高左右，放16塊主板，比服務(wù)器占的空間還小，我明年準(zhǔn)備自己搞一套這樣的系統(tǒng)用，16塊主板的話估計(jì)6萬(wàn)-10萬(wàn)可以搞定，64核心，256G內(nèi)存，計(jì)算能力應(yīng)該很可觀了�，F(xiàn)在主要是散熱和防塵方案沒想好，別的應(yīng)該都沒有問題。

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7樓2010-12-16 23:28:05

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lbambool

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★ ★
zzy870720z(金幣+2):謝謝交流 2010-12-17 08:14:50

http://www.loveunix.net/thread-106191-1-1.html
圖文詳解文件柜內(nèi)DIY自己的Linux集群機(jī)
找到這篇文章了，是6塊主板放一個(gè)文件柜里，總共24核心，主頻2.4GHz，48GB內(nèi)存，總功率只有400瓦。這臺(tái)集群機(jī)的浮點(diǎn)運(yùn)算能力達(dá)到了186Gflops
現(xiàn)在配3G主頻的Q9650，4條4G內(nèi)存共16G，1T硬盤，估價(jià)4300一個(gè)節(jié)點(diǎn)，6個(gè)節(jié)點(diǎn)2.6萬(wàn)可以搞下來，浮點(diǎn)運(yùn)算能力約230Gflops，呵呵，這樣性價(jià)比才高。

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8樓2010-12-16 23:49:47

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風(fēng)間的記憶

鐵桿木蟲 (著名寫手)

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★
zzy870720z(金幣+1):鼓勵(lì)討論交流 2010-12-17 10:14:52

哎即使是40W 6個(gè)節(jié)點(diǎn) 這性價(jià)比也太差了！！
40W 應(yīng)該能配到12-16個(gè)節(jié)點(diǎn)。。。。。。。。。。。
你提的這些問題曙光應(yīng)該可以承諾完成啊~~~

你們被設(shè)備處黑錢了吧

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9樓2010-12-17 09:39:53

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lbambool

木蟲 (著名寫手)

會(huì)不會(huì)40萬(wàn)里包括了軟件費(fèi)呢？加上MS應(yīng)該差不多這個(gè)價(jià)了

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10樓2010-12-17 10:03:32

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gongjijun

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引用回帖:

Originally posted by lbambool at 2010-12-16 23:49:47:
http://www.loveunix.net/thread-106191-1-1.html
圖文詳解文件柜內(nèi)DIY自己的Linux集群機(jī)
找到這篇文章了，是6塊主板放一個(gè)文件柜里，總共24核心，主頻2.4GHz，48GB內(nèi)存，總功率只有400瓦。這臺(tái)集 ...

非常高興能夠分享您的寶貴經(jīng)驗(yàn)。
我是打算在兩年后自己搞個(gè)24核的小集群玩玩，現(xiàn)在還沒有畢業(yè)，沒錢！

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11樓2010-12-17 10:06:42

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bmehuwei

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★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖

lz是哪個(gè)學(xué)校的啊，如何查學(xué)校有沒有購(gòu)買MS-CASTEP呢？

我是華中科技大學(xué)，網(wǎng)上查了好久，有個(gè)碩士畢業(yè)論文里面寫了用到CASTEP，仔細(xì)看了致謝里面沒有提到感謝誰(shuí)提供軟件，這種情況應(yīng)該是買了吧
如果一個(gè)學(xué)校有實(shí)驗(yàn)室或是機(jī)構(gòu)買了，整個(gè)學(xué)校都可以用了吧，不用特別提出了吧

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12樓2011-10-26 05:49:29

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