[交流] 【求助】建模問(wèn)題

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1樓 2010-12-17 20:56:19

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zyj8119

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ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-12-18 20:36:33

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Originally posted by amynihao at 2010-12-17 20:56:19:
玻璃態(tài)的無(wú)規(guī)則體系的模型怎么建啊？就像下圖這樣的是怎么建摸的��？

希望各位高手們幫忙解答一些，謝謝。

假如你用MS的話，可能要先畫(huà)一條聚合物鏈，然后使用AMORPHOROUS CELL模塊，選擇合適的力場(chǎng)建成盒子，只要知道單個(gè)的鏈的化學(xué)式就好了。

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4樓2010-12-18 11:05:19

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化工催化劑

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ghcacj(金幣+1):謝謝 2010-12-18 20:36:19
amynihao(金幣+1): 2010-12-19 09:51:44

這個(gè)問(wèn)題你應(yīng)該找一個(gè)學(xué)數(shù)學(xué)的童鞋給你講解一下化學(xué)人數(shù)學(xué)普遍不好啊。

2樓2010-12-18 10:46:11

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zyj8119

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amynihao(金幣+6): 2010-12-19 09:48:27

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Originally posted by amynihao at 2010-12-17 20:56:19:
玻璃態(tài)的無(wú)規(guī)則體系的模型怎么建啊？就像下圖這樣的是怎么建摸的啊？

希望各位高手們幫忙解答一些，謝謝。

這個(gè)玻璃態(tài)的化合物的化學(xué)式是什么樣的？

3樓2010-12-18 10:51:05

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amynihao

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Originally posted by zyj8119 at 2010-12-18 11:05:19:

假如你用MS的話，可能要先畫(huà)一條聚合物鏈，然后使用AMORPHOROUS CELL模塊，選擇合適的力場(chǎng)建成盒子，只要知道單個(gè)的鏈的化學(xué)式就好了。

它的化學(xué)式是CaO-SiO2-Al2O3
其中各個(gè)部分的比例是可以變化的。

5樓2010-12-19 09:50:44

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老虎大王

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ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-12-20 14:54:38

各原子隨機(jī)占位就可以�？梢杂肍CC晶格，或者BCC晶格，都可以。

6樓2010-12-19 10:56:21

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amynihao

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Originally posted by 老虎大王 at 2010-12-19 10:56:21:
各原子隨機(jī)占位就可以�？梢杂肍CC晶格，或者BCC晶格，都可以。

請(qǐng)問(wèn)您說(shuō)的這個(gè)各原子隨機(jī)占位怎么設(shè)置呢？

7樓2010-12-19 11:11:01

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Originally posted by 老虎大王 at 2010-12-19 10:56:21:
各原子隨機(jī)占位就可以。可以用FCC晶格，或者BCC晶格，都可以。

難道需要編程，是用隨機(jī)數(shù)產(chǎn)生程序，隨時(shí)分配？

8樓2010-12-19 12:03:04

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老虎大王

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amynihao(金幣+2): 2010-12-19 19:24:51
zh1987hs(金幣+3):謝謝 2010-12-19 23:05:29

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Originally posted by amynihao at 2010-12-19 11:11:01:

請(qǐng)問(wèn)您說(shuō)的這個(gè)各原子隨機(jī)占位怎么設(shè)置呢？

這個(gè)是要編程的。一個(gè)比較方便的辦法是你先用工具生成一個(gè)FCC或者BCC金屬體系，得到格點(diǎn)位置坐標(biāo)，格點(diǎn)數(shù)目等于或者稍大于你的體系的原子數(shù)目，然后對(duì)于每一個(gè)晶格，隨機(jī)地用你系統(tǒng)里的原子去填充它。具體方法你自己設(shè)計(jì)。

9樓2010-12-19 18:31:52

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zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-12-19 23:05:38

當(dāng)然你也可以不用晶格，而是用完全隨機(jī)的方式，就是在給定范圍內(nèi)隨機(jī)給原子生成坐標(biāo)，而不把原子放在規(guī)則的格點(diǎn)上。不過(guò)這種方式可能會(huì)使原子重疊較大，MD運(yùn)行很容易崩潰，你要小心地多試幾次。即使放到晶格上，同樣也有可能會(huì)因勢(shì)能過(guò)大，進(jìn)而導(dǎo)致溫度失控，你開(kāi)始時(shí)要把MD步長(zhǎng)盡量搞小一些，經(jīng)過(guò)一段試運(yùn)行，如果程序不崩潰，你就得到了一個(gè)初始構(gòu)型，然后在此基礎(chǔ)上開(kāi)始模擬。

10樓2010-12-19 18:37:45

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Originally posted by 老虎大王 at 2010-12-19 18:31:52:

這個(gè)是要編程的。一個(gè)比較方便的辦法是你先用工具生成一個(gè)FCC或者BCC金屬體系，得到格點(diǎn)位置坐標(biāo)，格點(diǎn)數(shù)目等于或者稍大于你的體系的原子數(shù)目，然后對(duì)于每一個(gè)晶格，隨機(jī)地用你系統(tǒng)里的原子去填充它。具體方 ...

專家您好，謝謝您這么詳細(xì)的解答，但是我看完之后還是不知道具體該怎么做，您這里指的這個(gè)工具是什么工具呢，還有就是如果用MS編程的話應(yīng)該怎么操作。因?yàn)镸S里自帶的結(jié)構(gòu)里也有很多玻璃態(tài)的結(jié)構(gòu)，比如硅酸納的結(jié)構(gòu)如下圖。其中紅色的原子為氧原子，黃色原子為硅原子，紫色為鈉原子。你知道這種結(jié)構(gòu)是怎么建的嗎？也需要編程實(shí)現(xiàn)嗎？非常感謝您的回答。

[ Last edited by amynihao on 2010-12-19 at 19:42 ]

11樓2010-12-19 19:40:33

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amynihao(金幣+1): 2010-12-20 10:23:21
ghcacj(金幣+10):謝謝 2010-12-20 14:54:17

MS我不大會(huì)用啊。我說(shuō)的工具，就是你熟悉的常用的生成晶體結(jié)構(gòu)的工具啊，但我本人是很少用這些工具的，基本上都是自己編程序。有時(shí)候可以用GULP之類的軟件先生成一個(gè)原胞，然后再在MD程序里擴(kuò)展。現(xiàn)在我知道Crystalmaker是很好用的生成晶體結(jié)構(gòu)的工具。
既然你用MS就好辦了，MS不僅能夠方便地生成晶體結(jié)構(gòu)，還能直接生成非晶態(tài)的起始結(jié)構(gòu)。應(yīng)該是比較方便的，但這個(gè)軟件我不大用啊，不好意思。好像是有個(gè)amorphorous 結(jié)構(gòu)生成的菜單吧，你研究一下。這種軟件的特點(diǎn)就是易用，你自己摸索一下，看看幫助文件之類，肯定能搞定的。

12樓2010-12-20 09:07:24

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amynihao

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Originally posted by 老虎大王 at 2010-12-20 09:07:24:
MS我不大會(huì)用啊。我說(shuō)的工具，就是你熟悉的常用的生成晶體結(jié)構(gòu)的工具啊，但我本人是很少用這些工具的，基本上都是自己編程序。有時(shí)候可以用GULP之類的軟件先生成一個(gè)原胞，然后再在MD程序里擴(kuò)展。現(xiàn)在我知道Cryst ...

恩好的，非常感謝您的指導(dǎo)。

給您獻(xiàn)花了。