xwsooo

你現(xiàn)在進(jìn)行到什么程度了？現(xiàn)在以你僅知道要擴(kuò)增的基因和屬名，要找該屬的這個(gè)基因的保守序列為例，根據(jù)我的體會(huì)，則建議這樣操作：
① 通過(guò)ncbi找該屬代表種的該基因序列；
② 以該序列為比對(duì)模板，通過(guò)在線的Blast搜尋該屬(genus)或所有E<10^-50的基因序列，全部用fastn格式保存在文本文件中；
③對(duì)該文本文件用clustal X進(jìn)行排序，應(yīng)獲得一個(gè)aln文件；
④用Ugene打開(kāi)aln文件，在該軟件中的窗口中人工比對(duì)找到可能保守序列。條件是足夠長(zhǎng)，比如25bp，屬內(nèi)不相配的堿基最多3個(gè)，與其他屬的差異則在4個(gè)堿基以上，即既保守，又特異。符合這幾個(gè)條件即為保守序列，但是否適于設(shè)計(jì)引物，還要再考查。

[ Last edited by fukkim on 2012-8-20 at 16:08 ]

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5樓2012-08-20 16:05:03

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1057855樓: Originally posted by brightfuture01 at 2010-12-18 15:59:45
生物軟件網(wǎng)：http://www.bio-soft.net/format.html

您老人家就給別人一個(gè)軟件，再給一個(gè)網(wǎng)址，你覺(jué)得真的能幫助別人嗎？

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6樓2012-08-20 16:06:02

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1975918樓: Originally posted by fukkim at 2012-08-20 16:06:02
您老人家就給別人一個(gè)軟件，再給一個(gè)網(wǎng)址，你覺(jué)得真的能幫助別人嗎？...

你覺(jué)得你敲的那幾行字在google里面搜索不到么？

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7樓2012-08-20 16:41:38

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1975925樓: Originally posted by brightfuture01 at 2012-08-20 16:41:38
你覺(jué)得你敲的那幾行字在google里面搜索不到么？...

你原來(lái)敲的那個(gè)網(wǎng)址不是浪費(fèi)提問(wèn)人的時(shí)間嗎？
你將我的回復(fù)搜索出來(lái)看看。

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8樓2012-08-20 16:47:56

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1975927樓: Originally posted by fukkim at 2012-08-20 16:47:56
你原來(lái)敲的那個(gè)網(wǎng)址不是浪費(fèi)提問(wèn)人的時(shí)間嗎？
你將我的回復(fù)搜索出來(lái)看看。...

睜大你的眼睛看看樓主三樓的提問(wèn)。

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9樓2012-08-21 10:53:28

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1975975樓: Originally posted by brightfuture01 at 2012-08-21 10:53:28
睜大你的眼睛看看樓主三樓的提問(wèn)。...

那是因?yàn)槟阒皇歉艨辗乓粋€(gè)Clustal W軟件，搞得樓主丈二和尚摸不著頭腦，我針對(duì)的不是你這樣一個(gè)網(wǎng)址，你仔細(xì)睜大眼睛看我的疑問(wèn)：“您老人家就給別人一個(gè)軟件，再給一個(gè)網(wǎng)址，你覺(jué)得真的能幫助別人嗎？”
還有你所謂的軟件，完全是在浪費(fèi)別人的時(shí)間，樓主是一個(gè)連Clustal W軟件都不知道的人，他下載了這個(gè)軟件也不知如何用，就算會(huì)用，做了之后離找保守序列還有相當(dāng)大的距離，對(duì)他的幫助微乎其微，但閣下還覺(jué)得大恩于他一樣，真是可笑之極。另外，再麻煩你將我的回復(fù)在網(wǎng)上搜出來(lái)，不然我認(rèn)為你是信口開(kāi)河，將向版主投訴你，存在素質(zhì)低下、不尊重別人勞動(dòng)、肆意人身攻擊的嫌疑!

[ Last edited by fukkim on 2012-8-21 at 15:05 ]

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10樓2012-08-21 14:59:32

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1975984樓: Originally posted by fukkim at 2012-08-21 14:59:32
那是因?yàn)槟阒皇歉艨辗乓粋€(gè)Clustal W軟件，搞得樓主丈二和尚摸不著頭腦，我針對(duì)的不是你這樣一個(gè)網(wǎng)址，你仔細(xì)睜大眼睛看我的疑問(wèn)：“您老人家就給別人一個(gè)軟件，再給一個(gè)網(wǎng)址，你覺(jué)得真的能幫助別人嗎？”
還 ...

我真搞不懂你這種半瓶水的還在那里誤導(dǎo)別人，還自認(rèn)為回復(fù)的很好的樣子，笑死人了。

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11樓2012-08-21 15:06:52

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