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[交流]
【討論】怎樣在平衡后生成最終的psf？pdb？？謝謝指點 已有3人參與
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我自己模建的一個蛋白的三維結(jié)構(gòu)，平衡動力學后，RMSD值也不錯，就想生成像結(jié)晶那樣含有水分子的pdb，以便后面的分析。我用這個命令生成的是含水合子的： 載入boule_wb.psf 載入boule_wb_eq.dcd 然后在Tk里輸入： set all [atomselect top protein] $all writepdb final.pdb $all writepsf final.psf 怎樣才能生成像結(jié)晶那樣含有水分子的pdb呢？、謝謝各位指點了 |
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