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【求助】dlpoly跑動力學(xué)生成的體系，分散到盒子的頂點上了，這是怎么一回事？應(yīng)該怎么 已有3人參與
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我用dlpoly跑動力學(xué)生成的REVCON文件，然后我把REVCON文件轉(zhuǎn)換成Gromacs軟件中的.gro文件，用VMD查看這個.gro文件，主要是想看看我模擬的體系是一個什么狀態(tài)，結(jié)果出現(xiàn)下面這樣的圖片：我的體系分散成在盒子的幾個頂點上了，這是怎么產(chǎn)生的，應(yīng)該怎么避免這樣的情況�？墒俏以趘md中在xyz方向多加一個盒子，即用2*2*2個盒子來查看，這時每一個頂點上都是一個完整的體系。。 [ Last edited by tpp001 on 2010-12-20 at 22:25 ] |
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david.wang
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6樓2010-12-29 21:43:27
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