小魚-xf

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[交流] 【求助】這個(gè)錯(cuò)誤是怎么回事呢？

麻煩幫忙看下這個(gè)錯(cuò)誤是怎么回事。非常謝謝！

輸入
%mem=400MW
%NprocShared=8
%LindaWorker=node5-ib
%nprocshared=8
%chk=9-px
#p pbe1pbe/6-311g(d) td(singlets,nstates=60,root=1) geom=check  gfinput gfprint iop(6/7=3)

molecule 1+2+3+2

0 1

輸出結(jié)果
Bad file opened by FileIO:  Unit=2 LstWrd= 120586240 LenFil= 120574129 NIntWP=1.
FileIO: IOper= 9 IFilNo(1)=    2 Len=          0 IPos=          0 Q=       6554520

dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    65536 FType=2 FMxFil=10000

Number          0
Base       40448
End       65536
End1       65536
Wr Pntr    40448
Rd Pntr    40448
Length    25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

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1樓 2010-12-28 14:25:06

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fatpig8832

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小魚-xf(金幣+1):謝謝！ 2010-12-28 19:22:46

看樣子是讀取chk文件出錯(cuò)...

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2樓2010-12-28 17:42:19

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zhangmt

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小魚-xf(金幣+4):非常感謝您解釋的這么詳細(xì)！ 2010-12-28 19:24:33
erylingjet(金幣+5):Perfect! 2010-12-28 23:01:55

從Bad file opened by FileIO和NtrErr Called from FileIO看，顯然是文件讀寫錯(cuò)誤。
從dumping /fiocom/看，顯然是linux操作系統(tǒng)，那么一般不會(huì)是由于單個(gè)文件超過(guò)2G造成的限制，從LindaWorker=node5-ib看，你的機(jī)器是通過(guò)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行并行的，那么極大的可能是網(wǎng)絡(luò)中斷造成讀寫錯(cuò)誤，或者是scr目錄被寫滿，硬盤空間不夠造成的。
從LenFil= 120574129 看，才寫了120M就出錯(cuò)，硬盤空間不夠的可能性不大，所以網(wǎng)絡(luò)故障是最大的可能。
你沒有明確說(shuō)是運(yùn)行了一段時(shí)間還是剛運(yùn)行就出錯(cuò)。如果是運(yùn)行很長(zhǎng)一段時(shí)間，那么就是剛才說(shuō)的原因，如果是剛運(yùn)行就出這個(gè)問(wèn)題，那么可能是linux系統(tǒng)的設(shè)置問(wèn)題，要取消linux的讀寫緩存功能即可。

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3樓2010-12-28 17:48:50

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Originally posted by zhangmt at 2010-12-28 17:48:50:
從Bad file opened by FileIO和NtrErr Called from FileIO看，顯然是文件讀寫錯(cuò)誤。
從dumping /fiocom/看，顯然是linux操作系統(tǒng)，那么一般不會(huì)是由于單個(gè)文件超過(guò)2G造成的限制，從LindaWorker=node5-ib看，你的 ...

是剛運(yùn)行一會(huì)就出錯(cuò)了，我這是UNIX的，弱弱的問(wèn)一下怎么改變讀寫緩存功能呢？

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4樓2010-12-28 19:25:59

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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
小魚-xf(金幣+2):謝謝！ 2010-12-29 17:12:42

it could be the case 2L mentions. Either the chk file is bad (i.e., previous calculation is not normally ended), or it is from a different version of gaussian.

g09 cannot directly read the g03 chk file, which gives an error.

if it is that case, use the c8609 utility to convert the chk file to the right version.

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5樓2010-12-29 12:29:48

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mscic

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★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
小魚-xf(金幣+2):謝謝您的回答！ 2010-12-29 17:13:12

應(yīng)該是讀取CHK文件出錯(cuò)，你的CHK文件不存在或者不在當(dāng)前指定的路徑

geom=check

請(qǐng)確定你的CHK文件存在，并且在你的提交的這個(gè)作業(yè)的目錄下面，否則是無(wú)法讀取的。

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6樓2010-12-29 14:39:27

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Originally posted by mscic at 2010-12-29 14:39:27:
應(yīng)該是讀取CHK文件出錯(cuò)，你的CHK文件不存在或者不在當(dāng)前指定的路徑

geom=check

請(qǐng)確定你的CHK文件存在，并且在你的提交的這個(gè)作業(yè)的目錄下面，否則是無(wú)法讀取的。

呵呵，我已經(jīng)把CHK文件重新讀入了，這次應(yīng)該沒什么問(wèn)題了！

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7樓2010-12-29 17:14:58

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Originally posted by mchen10 at 2010-12-29 12:29:48:
it could be the case 2L mentions. Either the chk file is bad (i.e., previous calculation is not normally ended), or it is from a different version of gaussian.

g09 cannot directly read the g03 ...

我用的一直是G09版本的，應(yīng)該是CHK文件讀入的問(wèn)題。

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8樓2010-12-29 17:16:14

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