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[交流]
【求助】Segmentation fault
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裝好了vasp5，從網(wǎng)上下載了例子，可第一個跑的例子就發(fā)生錯誤啦。（跑benchmark還沒問題），我是用intel的ifort-11和mpich2編譯的，那位有類似的經(jīng)驗，可以分享下嘛？(后來發(fā)現(xiàn)并不是每個例子都會報錯，第一個報錯啦，后面幾個沒報錯) 萬分感謝啊。 running on 1 nodes distr: one band on 1 nodes, 1 groups vasp.5.2.8 07Jul10 complex POSCAR found : 1 types and 1 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected FFT: planning ...( 1 ) reading WAVECAR WARNING: random wavefunctions but no delay for mixing, default for NELMDL entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) Segmentation fault [ Last edited by enola on 2010-12-29 at 17:40 ] |
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 vasp編譯問題集錦 |
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★ ★ ★
ellsaking(金幣+3):謝謝詳細指導！ 2010-12-31 10:22:46
enola(金幣+3):謝謝呢。 2010-12-31 15:25:41
ellsaking(金幣+3):謝謝詳細指導！ 2010-12-31 10:22:46
enola(金幣+3):謝謝呢。 2010-12-31 15:25:41
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首先確認一下你的內(nèi)存是否足夠，其次，作為嘗試： 1.把cutoff取小點試試 2.把k點減少再試試 如果能跑起來，基本上就是編譯器的問題了 以前的帖子里有討論這個問題，編譯時修改一個參數(shù)，在FFLAGS里加-heap-arrays 64試試看 [ Last edited by hakuna on 2010-12-31 at 09:14 ] |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
tuhaidan2樓2010-12-31 09:10:19
3樓2010-12-31 15:27:33
4樓2010-12-31 21:38:50
5樓2011-11-01 11:27:12
6樓2011-11-01 16:47:33
7樓2011-11-01 16:58:57
★ ★
youzhizhe(金幣+2): 謝謝交流。 2011-11-02 09:24:59
youzhizhe(金幣+2): 謝謝交流。 2011-11-02 09:24:59
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sorry, only can input english: 1. first check the size of the stack ulimit -a set ulimit statck to unlimited. if it works, then congs, the problem solved, ########################### core file size (blocks, -c) unlimited data seg size (kbytes, -d) unlimited scheduling priority (-e) 20 file size (blocks, -f) unlimited pending signals (-i) 16382 max locked memory (kbytes, -l) 64 max memory size (kbytes, -m) unlimited open files (-n) 1024 pipe size (512 bytes, -p) 8 POSIX message queues (bytes, -q) 819200 real-time priority (-r) 0 stack size (kbytes, -s) unlimited cpu time (seconds, -t) unlimited max user processes (-u) unlimited virtual memory (kbytes, -v) unlimited file locks (-x) unlimited ################################## else you have to check your compiling. |
8樓2011-11-02 08:56:47
9樓2011-11-02 09:05:06
我也查過了 在終端里輸入ulimited命令，結果顯示unlimited 10樓2011-11-02 09:20:00
11樓2011-11-02 09:25:56
12樓2011-11-02 11:38:13
13樓2011-11-02 14:54:06
14樓2011-11-03 08:33:37
15樓2011-11-03 16:04:36
★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
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intel的編譯器干活的，當體系一大，剛進入主循環(huán)就會退出來，并提示上面的錯誤！前面提到降低截斷能、減少K點主要是降低內(nèi)存的消耗，如果是這樣的的話，那便是內(nèi)存溢出了，原因在于編譯時INTEL默認將緩存寫在堆棧里，堆棧小時便會出現(xiàn)上述錯誤，你可以嘗試在編譯VASP時，在FFLAGS里加上參數(shù)-heap-arrays 64試試看，如果還不行的話，就換一下編譯器， 類似帖子 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2493388&fpage=1 |
16樓2011-11-03 18:06:19
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