 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 698 | 回復: 1 | |||
[交流]
【求助】VASP計算出錯--新年第一帖
|
|
首先祝蟲子們新年快樂啊。 我的計算環(huán)境如下： 我有兩個Nodes，是HP的BL460c G7，配置是 Intel X5670 24G內(nèi)存，兩塊20G的網(wǎng)卡。 我安裝的系統(tǒng)的Debian-Lenny, 64bits 編譯器是Intel的icc,ifort和MKL（version-11), 以及MPICH2。我已經(jīng) 安裝好VASP，才用Bewulf結(jié)構(gòu)，但是計算中出現(xiàn)了問題： 1.如果我只在一個node上做計算（只啟動一個node），采用mpirun，可以全速計算，MPI不會出現(xiàn)問題： 2.但是假如我同事啟動兩個，node0和node1（也就是兩個node有數(shù)據(jù)交流時，不管用的核多少），我使用mpirun時，當POSCAR 或者說計算的super cell超過一定值時，就會報如下的錯： ################################################### Fatal error in MPI_Waitall: Other MPI error, error stack: MPI_Waitall(261)..................: MPI_Waitall(count=46, req_array=0x7fffeeca46a0, status_array=0x7fffeeca4760) failed MPIDI_CH3I_Progress(150)..........: MPID_nem_mpich2_blocking_recv(948): MPID_nem_tcp_connpoll(1709).......: Communication error rank 23 in job 1 node0_55860 caused collective abort of all ranks exit status of rank 23: killed by signal 9 ###################################################舉個例子,VASP的例子，關(guān)于水的優(yōu)化： O atom in a box 1.0 ! universal scaling parameters 8.0 0.0 0.0 ! lattice vector a(1) 0.0 8.0 0.0 ! lattice vector a(2) 0.0 0.0 8.0 ! lattice vector a(3) 1 ! number of atoms cart ! positions in cartesian coordinates 0 0 0 當 “1.0 ! universal scaling parameters”，時，同時在兩個nodes上計算（也就是兩個node有數(shù)據(jù)交流時）會出錯的，但是在一個node上不會。 但是當把“1.0 ! universal scaling parameters”中的“1”修改成0.5時，就不會。 我也測試過不管怎么樣，當supercell超過4，就會出錯。 我想這可能是我編譯VASP時有問題啦，那位蟲子能給點建議嘛？謝謝。。。  |
回復此樓» 猜你喜歡
362求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復
-
求調(diào)劑 302分初試 0854
已經(jīng)有4人回復
-
299求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
312求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
315求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
土木304求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
316求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復
-
一志愿華東理工大學，080500學碩，317分，求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復
-
材料與化工306分找調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- vasp5.2計算誤差太大
已經(jīng)有11人回復
- VASP 磁性BerryPhase計算問題（Berryphase異常大）
已經(jīng)有3人回復
- VASP計算：如何處理波函數(shù)占用空間太大的問題
已經(jīng)有5人回復
- vasp 并行運算出錯
已經(jīng)有7人回復
- vasp計算靜態(tài)出現(xiàn)錯誤！
已經(jīng)有5人回復
- vasp計算在進行靜態(tài)計算時，出錯。
已經(jīng)有3人回復
- 【求助】vasp計算出錯，不知道問題出在哪里
已經(jīng)有5人回復
- 【求助】vasp計算過渡態(tài)結(jié)果出錯
已經(jīng)有17人回復
- 【求助】VASP 計算磁學性質(zhì)時出現(xiàn)錯誤
已經(jīng)有3人回復
- 【求助】使用vasp進行帶心凍結(jié)聲子計算的幾個問題~~~
已經(jīng)有9人回復
- 【求助】vasp5 光學計算結(jié)果問題
已經(jīng)有4人回復
- 【求助】vasp靜態(tài)計算能量值錯誤
已經(jīng)有21人回復
- 【求助】用vasp計算磁矩的問題
已經(jīng)有13人回復
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
2026年浙江農(nóng)林大學園藝學院碩士招收，接受碩士調(diào)劑學生
+1/190
-
中國科學院過程工程研究所 能源環(huán)境課題組 博士后招聘啟示
+1/183
-
招化學相關(guān)專業(yè)碩士調(diào)劑生
+1/96
-
藥物化學學碩接收調(diào)劑生1名
+1/94
-
歡迎調(diào)劑北京石油化工學院聚合物功能材料組
+1/84
-
化學，材料方向研究生調(diào)劑
+2/52
-
企業(yè)出國訪問交流求助
+1/41
-
安徽工業(yè)大學有調(diào)劑名額
+1/39
-
大連工業(yè)大學 高分子材料 接收考研調(diào)劑
+1/38
-
上海工程技術(shù)大學亞穩(wěn)材料課題組招收碩士研究生
+2/36
-
福建師范大學生命科學學院071000生物學調(diào)劑
+1/19
-
招收調(diào)劑
+1/18
-
招聘科研助理——儲能方向（儲能、流體傳熱、CFD模擬）
+1/12
-
西北工業(yè)大學機電學院 復合材料加工制造方向招聘博士后
+1/8
-
三峽大學材化學院能源環(huán)保晶態(tài)材料課題組接收調(diào)劑，招收化學類碩士
+1/7
-
江西水利電力大學接收調(diào)劑08工學皆可
+1/6
-
誠聘博士科研人員（有機合成化學方向）
+1/5
-
齊齊哈爾大學李莉課題組誠招2026級考研調(diào)劑生（學碩和專碩）
+1/3
-
招收2026年度調(diào)劑碩士研究生
+1/3
-
廣東工業(yè)大學馬琳教授課題組招收2026年博士
+1/1
2樓2011-02-08 13:41:59
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 enola 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料340分調(diào)劑 +6 | 夏夜晚風_long 2026-04-02 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085600，材料與化工321分求調(diào)劑 +11 | 大饞小子 2026-03-28 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京科技，085601總分305求調(diào)劑 +9 | 半生瓜！ 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 310分求調(diào)劑 +4 | 成功上岸wang 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +3 | 好好讀書。 2026-04-01 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學324求調(diào)劑 +7 | hanamiko 2026-03-30 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿 南京航空航天大學 ，080500材料科學與工程學碩 +10 | @taotao 2026-03-31 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +9 | 楒桉 2026-03-28 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿a區(qū)211，085601-307分求調(diào)劑 +10 | 黨嘉豪 2026-03-31 | 23/1150 |
|
|
|
[考研] 346求調(diào)劑 一志愿070303有機化學 +11 | 蘿卜燉青菜 2026-03-28 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 254材料與化工求調(diào)劑 +3 | 翰冬林楠 2026-03-30 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩求調(diào)劑 +10 | hyl3153942 2026-03-29 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 263求調(diào)劑 +3 | DDDDuu 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈爾濱工業(yè)大學材料與化工方向336分 +13 | 辰沐5211314 2026-03-26 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 一志愿西電085401數(shù)一英一299求調(diào)劑 六級521 +4 | 愛吃大鴨梨 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 +16 | kikiki7 2026-03-30 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 本科211總分289，08工學真心求調(diào)劑 +3 | utopiaE 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +6 | @MZB382400 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 數(shù)一英一271專碩（085401）求調(diào)劑，可跨 +7 | 前行必有光 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 352分 化工與材料 +5 | 海納百川Ly 2026-03-27 | 5/250 |
|