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mxw1967

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[交流] 求助適配體與寡聚核苷酸探針區(qū)別

適配體與寡聚核苷酸探針在原理和制備應(yīng)用上的區(qū)別

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1樓 2011-02-22 09:56:53

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盧圣國(guó)

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1168770樓: Originally posted by abc5710110 at 2011-02-22 10:42:38:
小弟的理解是：適配體是關(guān)于一段ssDNA（作為適體）可以跟其他非DNA鏈的物質(zhì)（作為配體）特異性結(jié)合，如跟蛋白質(zhì)，細(xì)胞，組織等物質(zhì)結(jié)合，該鏈?zhǔn)怯肧ELEX技術(shù)從基因文庫(kù)中篩選出來(lái)的，長(zhǎng)度不一，有的達(dá)到50bp以上。 ...

那該基因序列應(yīng)該用到NCBI中那個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索啊謝謝！

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3樓2012-03-27 22:17:13

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abc5710110

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mxw1967(金幣+10, 博學(xué)EPI+1): 謝 2011-02-23 07:50:37

小弟的理解是：適配體是關(guān)于一段ssDNA（作為適體）可以跟其他非DNA鏈的物質(zhì)（作為配體）特異性結(jié)合，如跟蛋白質(zhì)，細(xì)胞，組織等物質(zhì)結(jié)合，該鏈?zhǔn)怯肧ELEX技術(shù)從基因文庫(kù)中篩選出來(lái)的，長(zhǎng)度不一，有的達(dá)到50bp以上。
寡聚核苷酸探針：應(yīng)該指的是ssDNA與ssDNA的結(jié)合，鏈長(zhǎng)一般不是很長(zhǎng)，鏈太長(zhǎng)，結(jié)合所需時(shí)間太長(zhǎng)，太短，目標(biāo)鏈的特異性難以保證，主要用于檢測(cè)細(xì)菌，病毒和突變基因。
鏈的制作過(guò)程期待達(dá)人解答

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2樓2011-02-22 10:42:38

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abc5710110

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1604166樓: Originally posted by 盧圣國(guó) at 2012-03-27 22:17:13:
那該基因序列應(yīng)該用到NCBI中那個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索啊謝謝！

NCBI可以搜到核酸和蛋白方面的數(shù)據(jù)，但能不能搜到適配體就不知道了，不過(guò)你可以先搜索一下你感興趣的適配體方面的文獻(xiàn)報(bào)道，看看有沒(méi)有，有的話直接拿來(lái)用就差不多了，如果沒(méi)有的話，就從適配體數(shù)據(jù)庫(kù)中找找吧。有專(zhuān)門(mén)的數(shù)據(jù)庫(kù)：
https://www.freebase.com/view/base/aptamer/views/aptamer

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC308828/

具體怎么查我沒(méi)試過(guò)，自己找找看吧

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4樓2012-03-28 10:25:42

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