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wwling
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[交流]
【求助/交流】請教下巢式PCR與二次PCR的區(qū)別 已有12人參與
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最近糾結(jié)于這個問題,具體的是因?yàn)椴惶彩絇CR,是不是只要有兩對引物就可以呢?看網(wǎng)上說的是直接拿第一輪PCR產(chǎn)物為模板做第二輪擴(kuò)增,想問的是為什么不直接用第二輪的引物擴(kuò)增,得到的產(chǎn)物做模板繼續(xù)用第二輪引物擴(kuò)增(即二次PCR)? 望蟲子們指導(dǎo)下~~ |
經(jīng)驗(yàn) |
金蟲 (著名寫手)
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在百度百科上找到些關(guān)于巣式PCR的信息,與普通PCR相比,優(yōu)點(diǎn)主要的提高了特異性,有效的減少了錯配影響。 http://baike.baidu.com/view/688277.htm |


木蟲之王 (文壇精英)
我愛打老虎
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巢式PCR雖然也是擴(kuò)增兩次,但是跟二次PCR相比,它的優(yōu)勢是多方面的。 巢式PCR的兩對引物是嵌套的,即第二對引物是在第一對引物往里的。 這點(diǎn)區(qū)別產(chǎn)生的優(yōu)點(diǎn)很多:能夠提高檢測的特異性,在巢式過程中往往第一輪的PCR 產(chǎn)物跑電泳啥都看不到,但是經(jīng)過第二輪的PCR,產(chǎn)物就很亮了。這點(diǎn)我深有體會, 曾經(jīng)試驗(yàn)室里一個兄弟幫別人檢測黃瓜根際真菌,只要一個孢子,液氮碾磨,做巢式 就能檢測出來。 這個優(yōu)點(diǎn)是二次PCR所不能媲美的。 另外還有一點(diǎn)就是從酶的角度分析,你從3kb的片段上擴(kuò)1kb的序列的效率要比1kb設(shè) 計(jì)引物擴(kuò)增自身高的多得多。聚合酶起作用的時(shí)候同樣需要擴(kuò)增起始位點(diǎn)的上游有一 段序列,方便結(jié)合。所以說,巢式PCR在檢測中的檢測限要比二次PCR低的低得多,要 更加靈敏。尤其是樣品中目的序列的豐度較低的情況下,巢式PCR的優(yōu)勢就展現(xiàn)出來了。 |

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