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gaods101@163

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[交流] 【求助】為什么運(yùn)行vasp機(jī)器卡的厲害

各位同仁大家好！小弟初學(xué)vasp，可運(yùn)行時(shí)就出現(xiàn)了問題，也不知道什么問題，我做的是層錯(cuò)的問題，移動(dòng)原子前的文件是可以運(yùn)行的，可移動(dòng)后就不行了，機(jī)器卡的幾乎動(dòng)不了，我top了一下cpu幾乎不工作，而內(nèi)存全都用了！我想移動(dòng)原子前后不一樣的只有原子坐標(biāo)不同啊，可為什么就不能運(yùn)行呢?麻煩各位給我看看！下面是我的poscar：
Pure Cu
1
3.6147000000000  -3.614700000000  0.00000000000
0.0000000000000  3.6147000000000  -3.61470000000
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36
Direct
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      0.866666667 0.633333333 0.547230435
      0.033333333 -0.033333333       0.625406212
      0.533333333 -0.033333333       0.625406212
      0.033333333 0.466666667 0.625406212
      0.533333333 0.466666667 0.625406212
INCAR是：
SYSTEM=Cu
ISTART=0
PREC=Accurate
ENCUT=273.2
ISYM=1
GGA=91
ISIF=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.1
NPAR=4
LPLANE=.TRUE.
麻煩幫我看看，謝謝！

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1樓 2011-02-28 14:57:06

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賀儀

鐵桿木蟲 (著名寫手)

★ ★
ellsaking(金幣+2): 寫的很到位啊，哈哈 2011-02-28 18:50:03

引用回帖:

Originally posted by gaods101@163 at 2011-02-28 14:57:06:
各位同仁大家好！小弟初學(xué)vasp，可運(yùn)行時(shí)就出現(xiàn)了問題，也不知道什么問題，我做的是層錯(cuò)的問題，移動(dòng)原子前的文件是可以運(yùn)行的，可移動(dòng)后就不行了，機(jī)器卡的幾乎動(dòng)不了，我top了一下cpu幾乎不工作，而內(nèi)存全都用了 ...

你的機(jī)子什么配置呀？這么多原子，空間體積這么大，還用Accurate，再加上ISYM=1 低對(duì)稱行，內(nèi)存肯定大，你該一些參數(shù)吧，把要求降低點(diǎn)

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2樓2011-02-28 17:30:37

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zhangguangping

木蟲 (著名寫手)

★
zzy870720z(金幣+1): 謝謝指點(diǎn) 2011-02-28 19:53:56

引用回帖:

Originally posted by 賀儀 at 2011-02-28 10:30:37:
你的機(jī)子什么配置呀？這么多原子，空間體積這么大，還用Accurate，再加上ISYM=1 低對(duì)稱行，內(nèi)存肯定大，你該一些參數(shù)吧，把要求降低點(diǎn)

內(nèi)存用完了，幾乎就卡死了。這個(gè)時(shí)候好像程序本身也跑不動(dòng)了吧！

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3樓2011-02-28 19:39:21

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引用回帖:

Originally posted by 賀儀 at 2011-02-28 17:30:37:
你的機(jī)子什么配置呀？這么多原子，空間體積這么大，還用Accurate，再加上ISYM=1 低對(duì)稱行，內(nèi)存肯定大，你該一些參數(shù)吧，把要求降低點(diǎn)

可是在移動(dòng)前，就這個(gè)設(shè)置算了不到半天就有結(jié)果了啊，移了原子后就跑不動(dòng)了！

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4樓2011-03-01 08:32:21

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Originally posted by zhangguangping at 2011-02-28 19:39:21:
內(nèi)存用完了，幾乎就卡死了。這個(gè)時(shí)候好像程序本身也跑不動(dòng)了吧！

是跑不動(dòng)，沒移原子前也就七八個(gè)小時(shí)，移了之后一天也沒結(jié)果

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5樓2011-03-01 08:33:52

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不行，改了，還是卡，只有換成原來原子位置才行，所以感覺應(yīng)該是POSCAR的原因，可又不知道問題出在哪里

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6樓2011-03-01 08:38:18

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zxzbl

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7樓2011-03-01 08:49:12

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veryman

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★ ★
zzy870720z(金幣+2): 謝謝指點(diǎn) 2011-03-01 11:50:40
gaods101@163(金幣+10): 2011-03-02 08:38:43
gaods101@163(金幣+5): 2011-03-03 11:02:39

移動(dòng)了原子之后結(jié)構(gòu)的對(duì)稱性下降，通過對(duì)稱性減少k點(diǎn)來減少的計(jì)算量在你移動(dòng)原子之后就沒了，也就是說計(jì)算時(shí)k點(diǎn)增加了很多，超過了你計(jì)算機(jī)內(nèi)存能夠承受的范圍。。

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8樓2011-03-01 09:00:11

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賀儀

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★
zzy870720z(金幣+1): 謝謝參與討論 2011-03-01 14:08:43
gaods101@163(金幣+2): 2011-03-02 08:41:43
gaods101@163(金幣+3): 2011-03-03 11:02:59

有幾個(gè)問題：
首先看你的數(shù)據(jù)不像是優(yōu)化后的，優(yōu)化后的我從來沒講過你這么整齊的數(shù)據(jù)，其次你的體系中原子之間的距離太大，有些最近的大于3A，你的晶包基失可能有問題。估計(jì)你第一次優(yōu)化沒有收斂

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9樓2011-03-01 13:00:50

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Originally posted by veryman at 2011-03-01 09:00:11:
移動(dòng)了原子之后結(jié)構(gòu)的對(duì)稱性下降，通過對(duì)稱性減少k點(diǎn)來減少的計(jì)算量在你移動(dòng)原子之后就沒了，也就是說計(jì)算時(shí)k點(diǎn)增加了很多，超過了你計(jì)算機(jī)內(nèi)存能夠承受的范圍。。

謝謝，我感覺應(yīng)該是這個(gè)原因吧，因?yàn)槲覝p少K點(diǎn)后，確實(shí)不卡了。

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10樓2011-03-02 08:41:12

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引用回帖:

Originally posted by 賀儀 at 2011-03-01 13:00:50:
有幾個(gè)問題：
首先看你的數(shù)據(jù)不像是優(yōu)化后的，優(yōu)化后的我從來沒講過你這么整齊的數(shù)據(jù)，其次你的體系中原子之間的距離太大，有些最近的大于3A，你的晶包基失可能有問題。估計(jì)你第一次優(yōu)化沒有收斂

我想無論是優(yōu)化還是自洽都必須計(jì)算，只要是計(jì)算就卡，所以，感覺你說的不是原因，但你提醒我，我確實(shí)忘了優(yōu)化了，謝謝！

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11樓2011-03-02 08:42:58

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