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cqb3172鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
【求助】vasp的編譯及運(yùn)行效率問(wèn)題 已有7人參與
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新配的cpu為xeon E5620的服務(wù)器 雙cpu，每個(gè)cpu4核可以8個(gè)線(xiàn)程。 軟件環(huán)境：全為最新版的免費(fèi)非商業(yè)intel fortran編譯器和mkl，并行使用openmpi 1.43 現(xiàn)在的問(wèn)題是，我編譯后，單機(jī)并行測(cè)試同一批作業(yè) 采用mpirun -np 8， 某個(gè)作業(yè)計(jì)算時(shí)間為7分多鐘 但采用mpirun -np 16的話(huà)，其計(jì)算時(shí)間竟然為14分鐘。 目前正在測(cè)試mpirun -np 4的計(jì)算所需時(shí)間 問(wèn)題： mpirun時(shí)，對(duì)于每一臺(tái)server，np的最大值到底為哪個(gè)？ cpu數(shù)量*core的數(shù)量？也就是8 cpu數(shù)量*線(xiàn)程數(shù)量？也就是16 另外machinefile里面應(yīng)該寫(xiě)slots=多少？ 還有就是根據(jù)以上情況，是否也有可能是我編譯或者設(shè)置哪里有問(wèn)題？ |
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wyxhenu
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10樓2011-03-02 11:21:34
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2樓2011-03-01 14:10:01
cqb3172
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4樓2011-03-01 14:42:53
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