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cqb3172鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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【求助】vasp的編譯及運(yùn)行效率問(wèn)題 已有7人參與
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新配的cpu為xeon E5620的服務(wù)器 雙cpu,每個(gè)cpu4核可以8個(gè)線程。 軟件環(huán)境:全為最新版的免費(fèi)非商業(yè)intel fortran編譯器和mkl,并行使用openmpi 1.43 現(xiàn)在的問(wèn)題是,我編譯后,單機(jī)并行測(cè)試同一批作業(yè) 采用mpirun -np 8, 某個(gè)作業(yè)計(jì)算時(shí)間為7分多鐘 但采用mpirun -np 16的話,其計(jì)算時(shí)間竟然為14分鐘。 目前正在測(cè)試mpirun -np 4的計(jì)算所需時(shí)間 問(wèn)題: mpirun時(shí),對(duì)于每一臺(tái)server,np的最大值到底為哪個(gè)? cpu數(shù)量*core的數(shù)量?也就是8 cpu數(shù)量*線程數(shù)量?也就是16 另外machinefile里面應(yīng)該寫(xiě)slots=多少? 還有就是根據(jù)以上情況,是否也有可能是我編譯或者設(shè)置哪里有問(wèn)題? |
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