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[交流] 【求助】IRC計(jì)算問題

我用TS方法一反應(yīng)的過渡態(tài)，只有一個(gè)虛頻，看著虛頻的振動(dòng)方向可以用，想用IRC驗(yàn)證一下，要怎么做？我用了#p b3lyp/6-31++g(d,p) irc=(calcfc,stepsize=5,maxpiont=5) 計(jì)算，為什么一算就死掉了？

[ Last edited by lijie110 on 2011-3-25 at 10:36 ]

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1樓 2011-03-24 17:33:22

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caipingl

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lijie110(金幣+1):謝謝參與
lijie110(金幣+10): 謝謝回復(fù) 送上金幣 2011-03-30 15:42:04

如果你保存了計(jì)算TS的chk文件，你可以讀取chk來計(jì)算IRC，這樣可以節(jié)省機(jī)時(shí)。建議分開算前后路徑：
copy TS的chk文件分別為forward.chk和reverse.chk，然后 irc=(rcfc,forward,stepsize=20,maxpoints=10)，步長取大些，我一般設(shè)為20，前后我一般各計(jì)算15個(gè)點(diǎn)。將得到的最后一個(gè)點(diǎn)全優(yōu)化，看是否能回到反應(yīng)物和產(chǎn)物。如果能回去說明得到的過渡態(tài)是對的。

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7樓2011-03-25 12:03:57

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liangshash

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Originally posted by boylc789 at 2011-04-05 13:36:12:
iop，怎么加？

iop（5/13=1，1/11=1）不加容易出錯(cuò)

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16樓2011-04-07 09:50:10

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Originally posted by lijie110 at 2011-03-24 17:33:22:
我用TS方法一反應(yīng)的過渡態(tài)，只有一個(gè)虛頻，看著虛頻的振動(dòng)方向可以用，想用IRC驗(yàn)證一下，要怎么做？我用了#p b3lyp/6-31++g(d,p) ir=(calcfc,stepsize=5,maxpiont=5) 計(jì)算，為什么一算就死掉了？

關(guān)鍵詞是irc=(.......)吧，是不是把irc，c弄丟了。呵呵

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2樓2011-03-25 10:12:48

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flowerge

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3樓2011-03-25 10:17:13

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Originally posted by flowerge at 2011-03-25 10:17:13:
關(guān)鍵詞是irc

你給點(diǎn)步長很小，可以多做幾個(gè)點(diǎn)，可以更好的看出趨勢

我把stepsize,maxpiont都加大了，試了幾種情況還是不行，能幫忙分析一下原因嗎？

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4樓2011-03-25 10:45:10

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Originally posted by dx357 at 2011-03-25 10:12:48:
關(guān)鍵詞是irc=(.......)吧，是不是把irc，c弄丟了。呵呵

是我打錯(cuò)了，計(jì)算時(shí)寫的是IRC，是什么原因呢？幫忙分析下...十分感謝！

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5樓2011-03-25 10:47:51

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panyang811

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lijie110(金幣+10): 送上金幣謝謝回復(fù) 2011-03-30 15:41:39

應(yīng)該是maxpoint，另外可以加上guess=read geom=allcheck

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6樓2011-03-25 11:28:41

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你應(yīng)該把出錯(cuò)信息貼出來，這樣大家才好幫你分析原因啊。

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8樓2011-03-25 12:04:44

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Originally posted by caipingl at 2011-03-25 12:04:44:
你應(yīng)該把出錯(cuò)信息貼出來，這樣大家才好幫你分析原因啊。

這是輸出的文件。多謝��！
一開始就死掉了

1/10=5,14=-1,18=40,22=1,26=3,29=120007,38=1,39=20,42=10/1,15;
2/29=3,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,38=6/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,22=1,39=20,42=10/15(1);
99//99;
2/29=3/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3/1;
5/5=2,38=5/2;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,22=1,39=20,42=10/15(-5);
2/29=3/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
Leave Link 1 at Fri Mar 25 15:01:12 2011, MaxMem=       0 cpu:    1.0
(Enter d:\G03W\l101.exe)
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       50 IPos=    20000 Q=       20905776

dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 14 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    826880 FType=2 FMxFil=10000

Number          0       501       502       598       989       991       992       993
Base       385536    303104    310784    333312    304128    307200    306688    302592
End       826880    304104    332834    333314    306628    310481    306693    302692
End1       826880    304128    333312    333824    306688    310784    307200    303104
Wr Pntr    385536    303104    310784    333312    304128    307200    306688    302592
Rd Pntr    385536    303104    310784    333312    304128    310481    306693    302692
Length    441344    1000    22050       2    2500    3281       5       100

Number       994       995       996       997       998       999
Base       20480    302080    21504    22016    20992    333824
End       20510    302090    21604    302022    21042    385076
End1       20992    302592    22016    302080    21504    385536
Wr Pntr    20480    302080    21504    22016    20992    333824
Rd Pntr    20510    302090    21604    302022    21042    335076
Length       30       10       100    280006       50    51252

dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    1 SizExt =       0 WInBlk =    512
               defal = F LstWrd =    66048 FType=2 FMxFil=10000

Number          0
Base       20480
End       66048
End1       66048
Wr Pntr    20480
Rd Pntr    20480
Length    45568

dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    66048 FType=2 FMxFil=10000

Number          0
Base       20480
End       66048
End1       66048
Wr Pntr    20480
Rd Pntr    20480
Length    45568
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

[ Last edited by lijie110 on 2011-3-25 at 15:09 ]

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9樓2011-03-25 15:03:31

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你讀取chk文件？“FileIO operation on non-existent file.”顯示讀取文件不存在。

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10樓2011-03-26 07:26:12

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11樓2011-03-26 16:34:12

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lijie110(金幣+10): 多謝，給你金幣表示感謝 2011-03-30 15:42:55

引用回帖:

Originally posted by lijie110 at 2011-03-25 15:03:31:
這是輸出的文件。多謝��！
一開始就死掉了

1/10=5,14=-1,18=40,22=1,26=3,29=120007,38=1,39=20,42=10/1,15;
2/29=3,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,3 ...

不是，應(yīng)該是你的chk文件的問題，無法從chk文件讀取坐標(biāo)信息以及力常數(shù)信息。你能將input文件貼出來嗎？我想應(yīng)該是你的輸入文件有問題。還有，如果你做IRC計(jì)算時(shí)使用與計(jì)算TS相同的chk文件名，那你的chk文件已經(jīng)被改寫。所以建議當(dāng)做IRC計(jì)算時(shí)要保留TS的chk文件并copy TS的chk為IRC的。這樣即使IRC計(jì)算出錯(cuò)也不用再重新計(jì)算力常數(shù)了。

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12樓2011-03-28 22:43:22

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fatpig8832

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引用回帖:

Originally posted by lijie110 at 2011-03-25 15:03:31:
這是輸出的文件。多謝！！
一開始就死掉了

1/10=5,14=-1,18=40,22=1,26=3,29=120007,38=1,39=20,42=10/1,15;
2/29=3,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,3 ...

這蛋疼的錯(cuò)誤信息...一看就知道是壓根沒讀取到chk文件...

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13樓2011-03-31 16:22:17

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liangshash

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貌似錯(cuò)的很多
沒讀CHECK文件，iop也沒加，reverse，forward也沒加。
先看書啦

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14樓2011-03-31 18:53:35

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boylc789

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引用回帖:

Originally posted by liangshash at 2011-03-31 18:53:35:
貌似錯(cuò)的很多
沒讀CHECK文件，iop也沒加，reverse，forward也沒加。
先看書啦

iop，怎么加？

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15樓2011-04-05 13:36:12

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簡單回復(fù)

boylc78917樓

2011-04-07 21:58 回復(fù)

引用回帖:

Originally posted by liangshash at 2011-04-07 09:50:10: iop（5/13=1，1/11=1）不加容易出錯(cuò)

3q

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