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honey寶貝金蟲 (初入文壇)
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【轉(zhuǎn)載】Gaussian入門技巧四（關(guān)于對(duì)稱性） 已有7人參與
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關(guān)于對(duì)稱性： 剛剛在zixia上看到zhuoliu的大作。結(jié)合自己以前知道的東西，總結(jié)一下。 1。gaussian中輸入什么對(duì)稱性，一般優(yōu)化的結(jié)果仍然還是那個(gè)對(duì)稱性，比如CO2，如果初始兩個(gè)CO鍵長(zhǎng)輸入不是完全相等（比如一個(gè)1.214,一個(gè)1.215），那么程序就會(huì)判斷為C∞v 對(duì)稱，那么優(yōu)化結(jié)果雖然鍵長(zhǎng)幾乎相等，但仍然認(rèn)為是C∞v ，這個(gè)從振動(dòng)頻率或者分子軌道對(duì)稱性上可以看出來(lái)。 2。有時(shí)計(jì)算過(guò)程中對(duì)稱性會(huì)變化，比如做過(guò)渡態(tài)的時(shí)候，這時(shí)需要用 IOP(2/16=3)，否則計(jì)算會(huì)出錯(cuò)退出。 3。比如用直角坐標(biāo)輸入一個(gè)正三角形構(gòu)型，其對(duì)稱性應(yīng)該是D3h，但是如果輸入的小數(shù)點(diǎn)后面的數(shù)字不夠多，那么常常得到的是C2v或其它。為了消除輸入文件中坐標(biāo)的有效位數(shù)的影響，得到較高的對(duì)稱性，可以降低對(duì)稱性判斷的嚴(yán)格性。一般可以用symm=loose，這等價(jià)于 IOP (2/17=4, 2/18=3)。還可以減小這4和3這兩個(gè)數(shù)值，使得更加loose，但不能過(guò)小，否則會(huì)出錯(cuò)。symm=loose只是在第一步判斷輸入構(gòu)型的對(duì)稱性時(shí)用到。 此外，也可以用gaussview來(lái)調(diào)整設(shè)置初始構(gòu)型的對(duì)稱性。 4。如果要降低對(duì)稱性，那么可以用symm(PG=C3v)等等來(lái)做。使判斷出來(lái)的對(duì)稱性為C3v的一個(gè)子群。即由PG來(lái)限制最高對(duì)稱性。 附用到的IOP的詳細(xì)解釋。 IOp(2/16) action taken if the point group changes during an optimization. IOP(2/16=0)Abort the job. IOP(2/16=1)Keep going. IOP(2/16=2)Keep going and leave symmetry on, using the old symmetry. IOP(2/16=3)Keep going and leave symmetry on, using the new symmetry IOp(17) Tolerance for distance comparisons in symmetry determination. 0 Default (determined in the symmetry package, currently 1.d-8). N>0 10-N. N<0 10N, use the same tolerance for orientation. IOp(18) Tolerance for non-distance comparisons in symmetry determination. 0 Default (determined in the symmetry package, currently 1.d-7). N>0 10 -N. N<0 10 N, use the same tolerance for orientation. （supi） 附加一個(gè)我的：有時(shí)候分子對(duì)稱性太高經(jīng)常無(wú)法優(yōu)化收斂，這時(shí)可以加一個(gè)nosymm，有時(shí)挺管用的。 |
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boylc789
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