 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1289 | 回復(fù): 5 | |||
[交流]
【討論】grompp產(chǎn)生的問題
|
|
用grompp -f em.mdp -c kor.gro -p kor.top -o kor.tpr產(chǎn)生了如下提示信息： Analysing Protein... Analysing residues not classified as Protein/DNA/RNA/Water and splitting into groups... Number of degrees of freedom in T-Coupling group rest is 523524.00 Largest charge group radii for Van der Waals: 0.735, 0.701 nm Largest charge group radii for Coulomb: 0.735, 0.701 nm WARNING 1 [file em.mdp]: The sum of the two largest charge group radii (1.435946) is larger than rlist (1.000000) 問一下我是不是把rlist值變大就可以了，還是需要其他的修改�。� [ Last edited by Jfreda on 2011-4-13 at 13:57 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
深圳大學(xué)碩士招生（2026秋，傳感器方向，僅錄取第一志愿）
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
278求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
化學(xué)工程321分求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
334求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
268求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
312求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有9人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 活性炭載體催化劑XRD 遇到的一些問題
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 請教一個問題！
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 關(guān)于污水處理中產(chǎn)生污泥的處理問題是否會產(chǎn)生一次新的變革
已經(jīng)有38人回復(fù)
- 優(yōu)青年申請書生成PDF后產(chǎn)生問題詢問
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 基體中同時(shí)存在細(xì)晶和粗晶，塑變時(shí)分別的流動速度，及應(yīng)力產(chǎn)生問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 關(guān)于COD測試時(shí)產(chǎn)生白色沉淀的問題！
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 兩人用endnote分別編輯文檔，但用不同的數(shù)據(jù)庫會產(chǎn)生什么問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】雞糞發(fā)酵產(chǎn)生的沼渣沼液的處理問題
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于萃取產(chǎn)生乳化層的問題
已經(jīng)有23人回復(fù)
- 【求助】一個關(guān)于等離子體產(chǎn)生的問題
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】反應(yīng)中產(chǎn)生沉淀不好過濾的問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 關(guān)于真菌轉(zhuǎn)化后產(chǎn)生異核體的問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
青島高校2026招生碩士研究生
+5/875
-
西湖大學(xué)工學(xué)院智能微型機(jī)器人實(shí)驗(yàn)室博士后招聘啟事
+4/228
-
散金幣，求好運(yùn)，祝面上順利！
+2/114
-
南京醫(yī)科大學(xué)生殖醫(yī)學(xué)與子代健康國重實(shí)驗(yàn)室-董飛宏課題組-學(xué)術(shù)碩士招生
+1/97
-
福建師范大學(xué)招收2026年化學(xué)、材料碩士3-4名
+1/81
-
博士后出站經(jīng)驗(yàn)請教
+1/78
-
何時(shí)使用 CODA™ 科里奧利質(zhì)量流量儀表- 艾里卡特（Alicat）
+2/52
-
1
+1/37
-
天津工業(yè)大學(xué)航空航天博士招生
+1/35
-
湘潭大學(xué)“過程強(qiáng)化與綠色化工”創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)補(bǔ)招2026年秋入學(xué)博士生
+1/35
-
中科院生態(tài)環(huán)境研究中心國重實(shí)驗(yàn)室招聘客座研究生1-2名
+1/31
-
招碩士調(diào)劑生
+2/26
-
【博士招生】武漢科技大學(xué)招收材料、化工、環(huán)境、冶金類2026年“申請-考核”制博士生
+1/8
-
上�？萍即髮W(xué)物質(zhì)學(xué)院招收有機(jī)化學(xué)方向2026級工程博士
+1/7
-
香港大學(xué)David Srolovitz教授課題組招聘「香江學(xué)者」博士后
+1/7
-
南方科技大學(xué)基礎(chǔ)免疫與微生物學(xué)系招聘科研助理1-2名，從事微生物與免疫學(xué)方向研究
+1/5
-
東北林業(yè)大學(xué)（211，雙一流）宋老師課題組招收高分子、化學(xué)、復(fù)合材料等方向研究生
+1/4
-
125603工業(yè)工程與管理調(diào)劑
+1/2
-
靜電紡絲：工藝原理、形貌調(diào)控與典型應(yīng)用
+1/2
-
江蘇南京林業(yè)大學(xué)-高分子功能材料和器件-招2名碩士研究生
+1/1
2樓2011-04-13 14:41:20
自己頂！ 3樓2011-04-14 15:02:32
★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-04-22 08:52:35
Jfreda(金幣+5): 2011-04-22 12:57:10
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-04-22 08:52:35
Jfreda(金幣+5): 2011-04-22 12:57:10
|
通常這個與你mdp文件的設(shè)置有關(guān)，比如運(yùn)用什么方法進(jìn)行求算（例如溫度或壓力用什么方法進(jìn)行控制）如果這些都適合你的體系，在你RLIST小于盒子邊長一半的情況下，你可以通過增加rlist以符合動力學(xué)模擬的要求，通常條件下Rlist要小于Rvdw [ Last edited by whl2dxl on 2011-4-22 at 17:30 ] |
4樓2011-04-22 00:20:12
5樓2013-10-31 14:08:50
6樓2016-11-14 20:54:04
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 Jfreda 的主題更新
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +5 | 簡單點(diǎn)0 2026-03-17 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +11 | zjl的號 2026-03-16 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +9 | 冬十三 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +6 | 孔志浩 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +3 | 困于星晨 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 08工科 320總分 求調(diào)劑 +4 | 梨花珞晚風(fēng) 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[論文投稿] 有沒有大佬發(fā)小論文能帶我個二作 +3 | 增銳漏人 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程調(diào)劑 +6 | 大可digkids 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 大米飯！ 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 求調(diào)劑 +13 | enenenhui 2026-03-13 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 22408總分284求調(diào)劑 +3 | InAspic 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中科大材料專碩319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +4 | 威化餅07 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[基金申請] 現(xiàn)在如何回避去年的某一個專家，不知道名字 +3 | zk200107 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 331求調(diào)劑（0703有機(jī)化學(xué) +5 | ZY-05 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 308 085701 四六級已過求調(diào)劑 +7 | 溫喬喬喬喬 2026-03-12 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工301求調(diào)劑 +5 | 奕束光 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，材料專碩317求調(diào)劑 +5 | lx8568 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工085600調(diào)劑求老師收留 +9 | jiaanl 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 土木第一志愿276求調(diào)劑，科研和技能十分豐富，求新興方向的導(dǎo)師收留 +3 | 土木小天才 2026-03-12 | 3/150 |
|