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kwit金蟲 (初入文壇)
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[求助]
cube結(jié)果文件如何限定結(jié)果范圍
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請幫忙看下: 現(xiàn)在有p1.com到p20.com，20個文件。用g03命令處理后，得到20個cube靜電勢文件。 發(fā)現(xiàn)每個cube文件的值都在不同區(qū)間，請問如何添加參數(shù)設(shè)置，把計(jì)算結(jié)果值統(tǒng)一限定在某個范圍內(nèi)（如-5到0）？ 下面是p1.com輸入文件： #am1 cube=(cards,potential) test nosymm title card 0 2 N 18.76800 -10.63500 -11.14500 H 18.08800 -10.03300 -10.72700 H 18.68600 -11.55700 -10.76700 H 18.63700 -10.66000 -12.13600 C 20.11700 -10.11300 -10.85100 H 20.16100 -9.13400 -11.31200 C 20.31500 -9.82400 -9.35200 H 21.38300 -9.53100 -9.21700 H 19.70900 -8.93600 -9.06400 C 20.01900 -10.98000 -8.40100 H 19.94900 -10.61200 -7.35600 H 19.04000 -11.43800 -8.66300 S 21.27200 -12.31800 -8.40200 C 20.44000 -13.49400 -7.35200 H 21.05800 -14.40700 -7.21100 H 20.23800 -13.06000 -6.34900 H 19.46800 -13.80500 -7.79200 C 21.26400 -10.96200 -11.44800 O 22.22800 -10.41100 -11.99000 C 22.22100 -12.92900 -13.63300 O 21.78000 -12.06900 -13.89200 O 22.82000 -13.64600 -13.98900 N 20.95700 -12.24000 -11.59000 H 20.06700 -12.57600 -11.28700 C 21.84700 -13.26500 -12.18200 H 22.76200 -13.25800 -11.60200 C 21.23100 -14.66800 -11.99800 H 21.95400 -15.40200 -12.42300 H 21.16000 -14.89300 -10.91000 C 19.87100 -14.90000 -12.66300 H 19.24800 -15.54600 -12.00300 H 19.34500 -13.92300 -12.76300 C 20.04200 -15.57300 -14.02900 H 20.77800 -14.98400 -14.62200 H 20.48000 -16.58500 -13.86500 C 18.72000 -15.69100 -14.78700 H 18.83500 -16.36000 -15.66900 H 17.92800 -16.11000 -14.12800 N 18.27600 -14.37300 -15.26300 H 17.37700 -14.46500 -15.77800 H 18.14500 -13.73600 -14.45100 H 18.99700 -13.97400 -15.89700 p1.cube -1 -30.000000 -24.000000 -30.000000 128 0.529177 0.000000 0.000000 128 0.000000 0.529177 0.000000 128 0.000000 0.000000 0.529177 |
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3樓2011-04-21 16:11:59
yyallen2003
木蟲 (知名作家)
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2樓2011-04-20 21:19:51
zhou2009
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- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
- 管轄: 量子化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
kwit(金幣+2): 2011-04-25 20:19:59
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你希望“把計(jì)算結(jié)果值統(tǒng)一限定在某個范圍內(nèi)（如-5到0）”是什么意思？ 你求potential，它的值有正有負(fù)，有大有小，為什么要限定？ 如果你只想考察、比較-5到0的potential的值，這通常僅只是分子的電荷集居部位（負(fù)離子）或孤對電子的部位，作圖時可將等值線的取值選擇為-5到0即可，如在sigmaplot中作圖時，這時此外的正值將不會出現(xiàn)在圖中。-5以外還有大量的負(fù)值，將也不會表達(dá)出來。負(fù)值表明此處電子蓬松，易于給出電子。 如果你只想考察、比較-5到0的這個空間的potential值，那么你在計(jì)算cube時，將起始點(diǎn)定在-5，終點(diǎn)定在0即可，（你現(xiàn)在起始點(diǎn)是 -30.000000 -24.000000 -30.000000 ），終點(diǎn)定在0是由調(diào)整格點(diǎn)數(shù)和步長來決定的。 你的分子如此之大，真想只看-5到0這個空間的么？ |
4樓2011-04-22 10:41:16
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