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vs570588木蟲 (正式寫手)
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[求助]
請(qǐng)問OTU，operational taxonomic unit是啥意思 已有2人參與
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| OTU/clones這個(gè)單位在克隆文庫里的單位是啥？我做的混合培養(yǎng)細(xì)菌，另外，問問DGGE切膠克隆建立文庫，大家是把所用條帶都切，還是只切亮的條帶？還有就是一個(gè)培養(yǎng)皿中大家一般送幾個(gè)菌落去測(cè)序？按道理一個(gè)培養(yǎng)皿中應(yīng)該是純菌了，如果送過去多個(gè)測(cè)序結(jié)果出現(xiàn)不一致，如何解釋？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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運(yùn)算的分類單位 operational taxonomic unit 縮寫OTU，指在數(shù)量分類學(xué)方面作為對(duì)象的分類單位之總稱，有種、變種、個(gè)體等。在用群析的時(shí)候，根據(jù)相似系數(shù)值和由任意標(biāo)準(zhǔn)去歸納整理有可能的，因?yàn)橐灿信c歷來分類單位的等級(jí)（rank）不一致的情況，所以使用了這個(gè)術(shù)語。 OTU，是指系統(tǒng)發(fā)生分析中的一個(gè)外部節(jié)點(diǎn)，是一個(gè)假定的分類單元；常見于動(dòng)植物種類系統(tǒng)發(fā)育分析。例如 6 clone/2 OTUs 是指要進(jìn)行系統(tǒng)分類分析的個(gè)體，即每2個(gè)待分析的個(gè)體包含6個(gè)克隆。 這里還有篇英文文獻(xiàn)：Defining operational taxonomic units using DNA barcode data http://www.bolinfonet.org/pdf/De ... barcodedata2005.pdf |
2樓2011-04-22 00:09:59
vs570588
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4樓2011-04-22 19:42:48
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6樓2014-10-20 17:29:41
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