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capchaline木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
請(qǐng)教如何在blast中完成這么個(gè)任務(wù)，或者其他數(shù)據(jù)庫(kù)？
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agg tga agg aat atg tct cca a PHD finger protein 20 agg tga aga tat att cct cca a PTEN 請(qǐng)教大家，如上面序列所示，我這里有一段PTEN的序列需要序列比對(duì)查找出，相同長(zhǎng)度內(nèi)序列相差4或者5nt的基因序列，比如PHD finger 20這種序列。 但是NCBI的blast里的序列比對(duì)怎么都是連續(xù)的呢，我需要總長(zhǎng)度不變，22nt長(zhǎng)度的序列里和目的序列有17nt以上相同的其他序列，怎么搜索呢？ |
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keeperw
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2樓2011-04-28 16:03:47
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