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200699wang新蟲(chóng) (正式寫手)
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[求助]
SMD中恒速牽拉和恒力牽拉有什么區(qū)別和聯(lián)系？
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| SMD中恒速牽拉和恒力牽拉有什么區(qū)別和聯(lián)系？初學(xué)NAMD，很多都不太懂，還望高手，多多指教，先謝謝啦！ |
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200699wang
新蟲(chóng) (正式寫手)
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3樓2011-05-12 14:37:37
CMLY
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【答案】應(yīng)助回帖
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御劍江湖(金幣+5): 歡迎常來(lái)本版，歡迎回答問(wèn)題 2011-05-12 09:08:12
200699wang(金幣+8): 2011-05-12 14:34:12
御劍江湖(金幣+5): 歡迎常來(lái)本版，歡迎回答問(wèn)題 2011-05-12 09:08:12
200699wang(金幣+8): 2011-05-12 14:34:12
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進(jìn)行恒速牽拉時(shí)，我們需要首先設(shè)定一個(gè)假想的原子作為施力原子，這個(gè)實(shí)際并不存在的原子就叫做假原子（dummy atom）。假原子通過(guò)一根假想的彈簧與系統(tǒng)中真實(shí)存在的某個(gè)原子（稱為SMD原子）相連，牽拉時(shí)，假原子以恒定的速度運(yùn)動(dòng)，因此稱這種牽拉方式為恒速牽拉。實(shí)際上被牽拉原子（SMD原子）的速度不是恒定的。SMD原子所受拉力由彈簧的形變和彈性系數(shù)決定 ：恒力牽拉。我們?nèi)孕枰潭ㄒ粋�(gè)原子并指定另一個(gè)原子被牽拉，但是拉力是恒定的，直接作用于SMD原子上。因此不需要指定假原子以及假想彈簧的彈性系數(shù) |
2樓2011-05-12 09:00:00
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