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Jfreda鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
能量?jī)?yōu)化時(shí)出錯(cuò)
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大家好，我在對(duì)體系進(jìn)行能量?jī)?yōu)化時(shí)，老是出現(xiàn)如下的錯(cuò)誤： Steepest Descents: Tolerance (Fmax) = 1.00000e+02 Number of steps = 10000 Stepsize too small, or no change in energy. Converged to machine precision, but not to the requested precision Fmax < 100 Double precision normally gives you higher accuracy. writing lowest energy coordinates. Steepest Descents converged to machine precision in 618 steps, but did not reach the requested Fmax < 100. Potential Energy = -3.6909910e+06 Maximum force = 3.1073354e+04 on atom 25609 Norm of force = 2.0544344e+02 改變em.mdp中的參數(shù)emtol,emstep,dt結(jié)果還是一樣，初始結(jié)構(gòu)檢查了也沒(méi)有錯(cuò)。 我現(xiàn)在用的是oplsaa立場(chǎng),其中的ffoplsaabon.itp, ffoplsaanb.itp文件時(shí)我從網(wǎng)上當(dāng)下來(lái)的，有關(guān)于磷脂的部分，上述的結(jié)果會(huì)不會(huì)跟這些參數(shù)文件的設(shè)置有關(guān)呢，請(qǐng)大家?guī)兔Ψ治鲆幌�，謝謝！ |
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Jfreda
鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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2樓2011-05-17 09:57:26
3樓2011-05-25 08:56:23
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