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Jfreda鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
能量優(yōu)化時出錯
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大家好，我在對體系進行能量優(yōu)化時，老是出現如下的錯誤： Steepest Descents: Tolerance (Fmax) = 1.00000e+02 Number of steps = 10000 Stepsize too small, or no change in energy. Converged to machine precision, but not to the requested precision Fmax < 100 Double precision normally gives you higher accuracy. writing lowest energy coordinates. Steepest Descents converged to machine precision in 618 steps, but did not reach the requested Fmax < 100. Potential Energy = -3.6909910e+06 Maximum force = 3.1073354e+04 on atom 25609 Norm of force = 2.0544344e+02 改變em.mdp中的參數emtol,emstep,dt結果還是一樣，初始結構檢查了也沒有錯。 我現在用的是oplsaa立場,其中的ffoplsaabon.itp, ffoplsaanb.itp文件時我從網上當下來的，有關于磷脂的部分，上述的結果會不會跟這些參數文件的設置有關呢，請大家?guī)兔Ψ治鲆幌�，謝謝！ |
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Jfreda
鐵蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 藥物設計與藥物信息
2樓2011-05-17 09:57:26
3樓2011-05-25 08:56:23
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